RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
GPS1-223	ENST00000584229	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		29.39	■■■□□ 2.3
GPS1-223	ENST00000584229	PNMA3	Q9UL41	463 aa		29.39	■■■□□ 2.3
GPS1-223	ENST00000584229	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
GPS1-223	ENST00000584229	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	C12orf42	Q96LP6	360 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR7	Q9Y216	660 aa		29.38	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	PARP14	Q460N5	1801 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2C8	P10632	490 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	OSBP	P22059	807 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	NT5C2	P49902	561 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		29.36	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	MCC	P23508	829 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	LPAR1	Q92633	364 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		29.35	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CHST3	Q7LGC8	479 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	TNKS	O95271	1327 aa		29.34	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L15	C9J2P7	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L11	C9JVI0	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L18	D6R9N7	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L22	D6RA61	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L19	D6RCP7	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L20	D6RJB6	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229		F5H6K3	240 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	KLRC3	Q07444	240 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	USP17L24	Q0WX57	530 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	29.33	■■■□□ 2.29
GPS1-223	ENST00000584229	ERICH2	A1L162	156 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB10	O96000	172 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	HSPA4	P34932	840 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	LBX1	P52954	281 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	MKL1	Q969V6	931 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	CPA4	Q9UI42	421 aa		29.32	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	SLFN13	Q68D06	897 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		29.31	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	TLR2	O60603	784 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	KRT32	Q14532	448 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	RASEF	Q8IZ41	740 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	USP26	Q9BXU7	913 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.3	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	MGAM	O43451	1857 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	FLOT1	O75955	427 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	TTC14	Q96N46	770 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	RLF	Q13129	1914 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		29.29	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	GPR25	O00155	361 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	PRC1	O43663	620 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	MCM5	P33992	734 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC96	Q2M329	555 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf34	Q49A92	452 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	NEK1	Q96PY6	1258 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		29.28	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	SLC1A4	P43007	532 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	HERVK_113	P62684	666 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
GPS1-223	ENST00000584229	ANTXR2	P58335	489 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	WTAP	Q15007	396 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.26	■■■□□ 2.27
GPS1-223	ENST00000584229	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		29.26	■■■□□ 2.27

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