RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 USP14P54578 494 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 AK2P54819 239 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 KLRC3Q07444 240 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 MOGSQ13724 837 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 ANKRD1Q15327 319 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 RASAL3Q86YV0 1011 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 PNMA1Q8ND90 353 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 BRF1Q92994 677 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 OTUD5Q96G74 571 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 GMCL1Q96IK5 515 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 MAP3K14Q99558 947 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 VCPKMTQ9H867 229 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 KAT14Q9H8E8 782 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 TRIM75PA6NK02 468 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 SLC10A3P09131 477 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 C1QTNF8P60827 252 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 ATP2B2Q01814 1243 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 LPAR1Q92633 364 aa14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 DDAH1O94760 285 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 NDUFB10O96000 172 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 GTF2A2P52657 109 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 FGD1P98174 961 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 APOBRQ0VD83 1088 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 SNAPC2Q13487 334 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 MTMR2Q13614 643 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 APOA5Q6Q788 366 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 ZNF654Q8IZM8 581 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 GOPCQ9HD26 462 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.46□□□□□ -0.09
LMO3-217ENST00000537757 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.46□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CCDC69A6NI79 296 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 ST18O60284 1047 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PDHBP11177 359 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 MCM2P49736 904 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 HMGCS2P54868 508 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SLFN13Q68D06 897 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 DCAF4Q8WV16 495 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SNX21Q969T3 373 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 NID2Q14112 1375 aa14.45□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 DOCK1Q14185 1865 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PLA2G6O60733 806 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CALM1P0DP23 149 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CALM2P0DP24 149 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CALM3P0DP25 149 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CETPP11597 493 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 HSPA6P17066 643 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 GRM4Q14833 912 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PPP2R5BQ15173 497 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 FANCBQ8NB91 859 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 FEZ1Q99689 392 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CEP350Q5VT06 3117 aa14.44□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 OTOFQ9HC10 1997 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 ZBTB43O43298 467 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 PFKFB2O60825 505 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 VCAM1P19320 739 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 INHBEP58166 350 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 ZNF543Q08ER8 600 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 DGKZQ13574 1117 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.43□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 BMP3P12645 472 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SMARCA1P28370 1054 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SLC1A4P43007 532 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 TM4SF4P48230 202 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 ME3Q16798 604 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.42□□□□□ -0.1
LMO3-217ENST00000537757 CAPNS2Q96L46 248 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms