RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, human

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP25-208	ENST00000478932	ECE2	O60344	883 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	DDAH1	O94760	285 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF202	O95125	648 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CMA1	P23946	247 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF165	P49910	485 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PDILT	Q8N807	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SLX4	Q8IY92	1834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932		A0A1W2PQ27	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932		A0A1W2PQ64	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932		A0A1W2PQD8	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ESPN	B1AK53	854 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KLRF2	D3W0D1	207 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZBTB7A	O95365	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ADCY5	O95622	1261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SCG2	P13521	617 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PFKFB1	P16118	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	XBP1	P17861	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KIF5B	P33176	963 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CRK	P46108	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	NPY5R	Q15761	445 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		4.75	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	NID2	Q14112	1375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	YDJC	A8MPS7	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PPIP5K2	O43314	1243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RAD21	O60216	631 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RAD17	O75943	681 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SYK	P43405	635 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	BAG6	P46379	1132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	NLRP5	P59047	1200 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF174	Q15697	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	IGSF3	O75054	1194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	AKR1B1	P15121	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	DPEP1	P16444	411 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KCNA3	P22001	575 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	GABPA	Q06546	454 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		4.74	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		4.73	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	CEP350	Q5VT06	3117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.73	□□□□□ -1.65
USP25-208	ENST00000478932	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65

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