RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.04■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PRG0 241 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 FOXP2O15409 715 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 OSBPP22059 807 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 RGS19P49795 217 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 ARHGEF6Q15052 776 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 C12orf42Q96LP6 360 aa25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 PEX10O60683 326 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 ARMC5Q96C12 935 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 FEZ1Q99689 392 aa25.02■■□□□ 1.6
CS-222ENST00000550996 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 GNRH1P01148 92 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 GNAT2P19087 354 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 FAM110CQ1W6H9 321 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 SRRDQ9UH36 339 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 ROBO3Q96MS0 1386 aa25■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 VCAM1P19320 739 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 FCGRTP55899 365 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 HERVK_113P62684 666 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.99■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 APPP05067 770 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 TDO2P48775 406 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 USP14P54578 494 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 PRKCZQ05513 592 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 ZNF333Q96JL9 665 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 CCDC17Q96LX7 622 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 FAM227BQ96M60 508 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 GABRQQ9UN88 632 aa24.98■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 MYPNQ86TC9 1320 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 A0A0D9SFI3 127 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 RASA1P20936 1047 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 PDE4AP27815 886 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 VPS53Q5VIR6 699 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 PRMT2P55345 433 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 ICA1Q05084 483 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.96■■□□□ 1.59
CS-222ENST00000550996 USP17L15C9J2P7 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L11C9JVI0 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L18D6R9N7 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L22D6RA61 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L19D6RCP7 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L20D6RJB6 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 USP17L24Q0WX57 530 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 HOXD10P28358 340 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TMX2Q9Y320 296 aa24.94■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 POTEFA5A3E0 1075 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 PRDM1O75626 825 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 CNMDO75829 334 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 RILPL2Q969X0 211 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.93■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MGAMO43451 1857 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 FLT3LGP49771 235 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 Q3C1V9 767 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 RAET1EQ8TD07 263 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 NAPBQ9H115 298 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MYH8P13535 1937 aa24.92■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 PPARAQ07869 468 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TICAM2Q86XR7 235 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-222ENST00000550996 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms