RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PTPN22Q9Y2R2 807 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 BCRP11274 1271 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HOXD10P28358 340 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PSMC4P43686 418 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NAPBQ9H115 298 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FCGRTP55899 365 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SH2D4AQ9H788 454 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AKR1B1P15121 316 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ICA1Q05084 483 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ACER1Q8TDN7 264 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GUCY1A2P33402 732 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRMT2P55345 433 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 C12orf42Q96LP6 360 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SMIM22K7EJ46 135 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRIM47Q96LD4 638 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L15C9J2P7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L11C9JVI0 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L18D6R9N7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L22D6RA61 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L19D6RCP7 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L20D6RJB6 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CAP1Q01518 475 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ATP2B2Q01814 1243 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PDE4BQ07343 736 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 USP17L24Q0WX57 530 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NBPF11Q86T75 865 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM227BQ96M60 508 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HIP1O00291 1037 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VCAM1P19320 739 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HERVK_113P62684 666 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SRRDQ9UH36 339 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 A0A0D9SFI3 127 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RAET1EQ8TD07 263 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HTTP42858 3142 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYPNQ86TC9 1320 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYH8P13535 1937 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SDSP20132 328 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PPARAQ07869 468 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COA7Q96BR5 231 aa23.54■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 A0A1W2PRG0 241 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RASA1P20936 1047 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CTGFP29279 349 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SOX10P56693 466 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LPAR1Q92633 364 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TMX2Q9Y320 296 aa23.53■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RAD21O60216 631 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRDM1O75626 825 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PDE4AP27815 886 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GOPCQ9HD26 462 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.52■■□□□ 1.36
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRKCZQ05513 592 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VPS53Q5VIR6 699 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VCPKMTQ9H867 229 aa23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CENPFP49454 3210 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TSPY3P0CV98 308 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TSPY8P0CW00 308 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ALX1Q15699 326 aa23.5■■□□□ 1.35
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TTC22Q5TAA0 569 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms