RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 SWAP70Q9UH65 585 aa23.19■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 FOXP2O15409 715 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 TDO2P48775 406 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 EVI5LQ96CN4 794 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 FAM227BQ96M60 508 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PNMA3Q9UL41 463 aa23.18■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 C19orf81C9J6K1 198 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.17■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 A0A0D9SFI3 127 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PDE4AP27815 886 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PRKCZQ05513 592 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 VPS53Q5VIR6 699 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 RILPL2Q969X0 211 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 GABRQQ9UN88 632 aa23.16■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PRDM1O75626 825 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 VCAM1P19320 739 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 SRRDQ9UH36 339 aa23.15■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 MYPNQ86TC9 1320 aa23.14■■□□□ 1.3
UPP1-205ENST00000417464 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 FCGRTP55899 365 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 HERVK_113P62684 666 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ICA1Q05084 483 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ARHGEF6Q15052 776 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 SBK1Q52WX2 424 aa23.14■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 GNAT2P19087 354 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RASA1P20936 1047 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ATP2B2Q01814 1243 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 C12orf42Q96LP6 360 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.13■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 POTEFA5A3E0 1075 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 SPICE1Q8N0Z3 855 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ARMC5Q96C12 935 aa23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 BRCA2P51587 3418 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 INCENPQ9NQS7 918 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.11■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 MYH8P13535 1937 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP14P54578 494 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RAET1EQ8TD07 263 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ZNF333Q96JL9 665 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 CCDC17Q96LX7 622 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 NAPBQ9H115 298 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.1■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L15C9J2P7 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L11C9JVI0 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L18D6R9N7 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L22D6RA61 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L19D6RCP7 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L20D6RJB6 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 GNRH1P01148 92 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 FLT3LGP49771 235 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RGS19P49795 217 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 USP17L24Q0WX57 530 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 Q3C1V9 767 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.09■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 CNMDO75829 334 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 ELNP15502 786 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 PPARAQ07869 468 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 PORCNQ9H237 461 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 MGAMO43451 1857 aa23.08■■□□□ 1.29
UPP1-205ENST00000417464 RAD21O60216 631 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-205ENST00000417464 SDSP20132 328 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-205ENST00000417464 HOXD10P28358 340 aa23.07■■□□□ 1.28
UPP1-205ENST00000417464 MTFR1Q15390 333 aa23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms