RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 PF4P02776 101 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLCG1P19174 1290 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 MESP2Q0VG99 397 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 PWP1Q13610 501 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 FYB2Q5VWT5 728 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLFN12Q8IYM2 578 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBE2FQ969M7 185 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM74Q96NL1 305 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 VTI1BQ9UEU0 232 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 CEP131Q9UPN4 1083 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 F13A1P00488 732 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 ESR1P03372 595 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 GLI1P08151 1106 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 YARSP54577 528 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC27Q2M243 656 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM13CQ8NE31 585 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIRREL1Q96J84 757 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM84AQ96KN4 292 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRS2Q9HD23 443 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-601P-201ENST00000384540 F6X3S4 739 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 SRFP11831 508 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GARTP22102 1010 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPP2Q14168 576 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GAB4Q2WGN9 574 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RELL1Q8IUW5 271 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KSR1Q8IVT5 923 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNF141Q8WVD5 230 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC38A3Q99624 504 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DBX1A6NMT0 343 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 UPK3BL1B0FP48 263 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 UPK3BL2E5RIL1 263 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF124Q15973 351 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 PKN1Q16512 942 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 MLANAQ16655 118 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 ERMP1Q7Z2K6 904 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNQ5Q9NR82 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLAMF8Q9P0V8 285 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM59LQ9UK28 342 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTR3BO95264 441 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAC2P15153 192 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM160A1Q05DH4 1040 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM67Q5HYA8 995 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 REC114Q7Z4M0 266 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC6Q86TZ1 520 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASPNQ9BXN1 380 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRC3Q9BY71 257 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 WASH4PA8MWX3 477 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 HPXP02790 462 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RALGPS1Q5JS13 557 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR23BQ6ZRT6 265 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 CREG2Q8IUH2 290 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXO27Q8NI29 283 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KREMEN1Q96MU8 473 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP1R16BQ96T49 567 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KBTBD4Q9NVX7 518 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHL3Q9UH77 587 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DUSP13Q9UII6 198 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRIN3BO60391 1043 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 DNAJA2O60884 412 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSPAN15O95858 294 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 CILP2Q8IUL8 1156 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 ABHD4Q8TB40 342 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 MINDY4BA8MYZ0 360 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRRN2O75325 713 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNNI2P48788 182 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 HK2P52789 917 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 EGR3Q06889 387 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 VWCEQ96DN2 955 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-601P-201ENST00000384540 SP110Q9HB58 689 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms