RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 USP40Q9NVE5 1235 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SNX16P57768 344 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SETDB1Q15047 1291 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 AZI2Q9H6S1 392 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.54■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MCTP2Q6DN12 878 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NEO1Q92859 1461 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 BCRP11274 1271 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 GCNT3O95395 438 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 USP21Q9UK80 565 aa22.53■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 MAEAQ7L5Y9 396 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.24e-9■■■■□ 19.9
CCSAP-203ENST00000366687 IFT20Q8IY31 132 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 USP28Q96RU2 1077 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 NIM1KQ8IY84 436 aa22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CCSAP-203ENST00000366687 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 FGAP02671 866 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PFKFB1P16118 471 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GYG1P46976 350 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MTX1Q13505 466 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 BLIDQ8IZY5 108 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 KIFC2Q96AC6 838 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.52■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM7Q9C029 511 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TNKSO95271 1327 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PALD1Q9ULE6 856 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR6Q9Y217 621 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 NOD1Q9Y239 953 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PNMA1Q8ND90 353 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC51Q96ER9 411 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TSKSQ9UJT2 592 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GINS2Q9Y248 185 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 IWS1Q96ST2 819 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 STAP2Q9UGK3 403 aa22.51■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 ATP2B4P23634 1241 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 UBE3CQ15386 1083 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PPIP5K2O43314 1243 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GNA14O95837 355 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GAS8O95995 478 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SPATA24Q86W54 205 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CEP104O60308 925 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC24Q50LG9 513 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CROCCP2Q86T23 111 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.5■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 BCAMP50895 628 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PDE8BO95263 885 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PNOCQ13519 176 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 ZMYM6O95789 1325 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 A6NNZ2 444 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CMA1P23946 247 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 DNM2P50570 870 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 MYOM2P54296 1465 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GAS7O60861 476 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TNFAIP1Q13829 316 aa22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 E7EVH7 732 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 CLUL1Q15846 466 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 DCUN1D2Q6PH85 259 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GPR108Q9NPR9 543 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 GALNT17Q6IS24 598 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 NLRX1Q86UT6 975 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB9Q96C00 473 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CCSAP-203ENST00000366687 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms