RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 GCKRQ14397 625 aa11.71□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.71□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP11.71□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 XKR9Q5GH70 373 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 DYMQ7RTS9 669 aa11.7□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 IGHDP01880 384 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRPS1-201ENST00000220888 SARNPP82979 210 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 TYRO3Q06418 890 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 KRT26Q7Z3Y9 468 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 TSPYL6Q8N831 410 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 RDH13Q8NBN7 331 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 PSTPIP2Q9H939 334 aa11.68□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRPS1-201ENST00000220888 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.67□□□□□ -0.54
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