RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022469.12

Nisch-201, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene Nisch, Length 5,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-201ENSMUST00000022469 Syne1Q6ZWR6 8799 aa6,31□□□□□ -1,4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap17-1A2A5X6 109 aa6,21□□□□□ -1,41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa6,21□□□□□ -1,42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11562A0PK51 136 aa6,2□□□□□ -1,42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ush2AQ2QI47 5193 aa6,13□□□□□ -1,43
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-2B1AQ85 167 aa6,07□□□□□ -1,44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa5,96□□□□□ -1,46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP5,95□□□□□ -1,46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc5bE9Q5I3 4800 aa5,9□□□□□ -1,46
Nisch-201ENSMUST00000022469 2300003K06RikA2A4M0 262 aa5,87□□□□□ -1,47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-16Q91W93 202 aa5,84□□□□□ -1,47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lce1kJ3QP15 125 aa5,82□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11564A2A4L9 201 aa5,81□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11563B1AQ90 168 aa5,81□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11595B1AQA7 289 aa5,81□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-8B1AQA8 209 aa5,81□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-9B1AQA9 244 aa5,78□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11596B1AQB0 205 aa5,78□□□□□ -1,48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-7Q9D732 168 aa5,77□□□□□ -1,49
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mt3P28184 68 aa5,73□□□□□ -1,49
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa5,63□□□□□ -1,51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lce1a1Q9CQH5 143 aa5,61□□□□□ -1,51
Nisch-201ENSMUST00000022469 SspoQ8CG65 4998 aa5,59□□□□□ -1,51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mt1P02802 61 aaKnown RBP5,5□□□□□ -1,53
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fsip2A2ARZ3 6995 aa5,43□□□□□ -1,54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP5,31□□□□□ -1,56
Nisch-201ENSMUST00000022469 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP5,16□□□□□ -1,58
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc16A0A140LJ72 8478 aa5,15□□□□□ -1,59
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa5,11□□□□□ -1,59
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sprr2bO70554 98 aa5,06□□□□□ -1,6
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11554B1AQB2 190 aa5,01□□□□□ -1,61
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa5□□□□□ -1,61
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11555B1AQ89 175 aa4,77□□□□□ -1,65
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4,5□□□□□ -1,69
Nisch-201ENSMUST00000022469 1110025L11RikO09048 78 aa4,48□□□□□ -1,69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-5Q925H3 78 aa4,48□□□□□ -1,69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa4,47□□□□□ -1,69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP4,39□□□□□ -1,71
Nisch-201ENSMUST00000022469 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP4,36□□□□□ -1,71
Nisch-201ENSMUST00000022469 Eppk1Q8R0W0 6548 aa4,25□□□□□ -1,73
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm10229O08631 77 aa4,21□□□□□ -1,74
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11568A2A4M2 211 aa4,17□□□□□ -1,74
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap9-1Q64526 186 aa4,17□□□□□ -1,74
Nisch-201ENSMUST00000022469 NebE9Q1W3 7152 aa4,11□□□□□ -1,75
Nisch-201ENSMUST00000022469 Phgr1Q8K0G7 91 aa4,03□□□□□ -1,76
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11559Q9D3H7 191 aa4,01□□□□□ -1,77
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc19Q6PZE0 7524 aa4□□□□□ -1,77
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa3,82□□□□□ -1,8
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa3,69□□□□□ -1,82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa3,55□□□□□ -1,84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hmcn1D3YXG0 5634 aa3,51□□□□□ -1,85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP3,42□□□□□ -1,86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa3,41□□□□□ -1,86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm2431E9Q8S1 172 aa3,38□□□□□ -1,87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-2O08884 159 aa3,36□□□□□ -1,87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap21-1Q925H4 128 aa3,23□□□□□ -1,89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa3,22□□□□□ -1,89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3,17□□□□□ -1,9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3,17□□□□□ -1,9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3,17□□□□□ -1,9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-4Q62220 223 aa3,17□□□□□ -1,9
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VJH8 109 aa3,17□□□□□ -1,9
Nisch-201ENSMUST00000022469 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP3,14□□□□□ -1,91
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa3,13□□□□□ -1,91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11567Q9D141 195 aa2,97□□□□□ -1,93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa2,9□□□□□ -1,94
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VLE6 161 aa2,7□□□□□ -1,98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa2,43□□□□□ -2,02
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa2,4□□□□□ -2,03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-1Q64507 230 aa1,73□□□□□ -2,13
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VJ07 166 aa1,72□□□□□ -2,13
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A286YCP9 139 aa1,55□□□□□ -2,16
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa1,26□□□□□ -2,21
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm4559A4IF42 199 aa1,25□□□□□ -2,21
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa1,22□□□□□ -2,21
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa1,15□□□□□ -2,23
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa1,13□□□□□ -2,23
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa1,09□□□□□ -2,23
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa0,94□□□□□ -2,26
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa0,93□□□□□ -2,26
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