RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022469.12

Nisch-201, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene Nisch, Length 5,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-201ENSMUST00000022469 Syne1Q6ZWR6 8799 aa6.31□□□□□ -1.4
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap17-1A2A5X6 109 aa6.21□□□□□ -1.41
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa6.21□□□□□ -1.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11562A0PK51 136 aa6.2□□□□□ -1.42
Nisch-201ENSMUST00000022469 Ush2AQ2QI47 5193 aa6.13□□□□□ -1.43
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-2B1AQ85 167 aa6.07□□□□□ -1.44
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa5.96□□□□□ -1.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc5bE9Q5I3 4800 aa5.9□□□□□ -1.46
Nisch-201ENSMUST00000022469 2300003K06RikA2A4M0 262 aa5.87□□□□□ -1.47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-16Q91W93 202 aa5.84□□□□□ -1.47
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lce1kJ3QP15 125 aa5.82□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11564A2A4L9 201 aa5.81□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11563B1AQ90 168 aa5.81□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11595B1AQA7 289 aa5.81□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-8B1AQA8 209 aa5.81□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-9B1AQA9 244 aa5.78□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11596B1AQB0 205 aa5.78□□□□□ -1.48
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-7Q9D732 168 aa5.77□□□□□ -1.49
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mt3P28184 68 aa5.73□□□□□ -1.49
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa5.63□□□□□ -1.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Lce1a1Q9CQH5 143 aa5.61□□□□□ -1.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 SspoQ8CG65 4998 aa5.59□□□□□ -1.51
Nisch-201ENSMUST00000022469 Mt1P02802 61 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
Nisch-201ENSMUST00000022469 Fsip2A2ARZ3 6995 aa5.43□□□□□ -1.54
Nisch-201ENSMUST00000022469 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
Nisch-201ENSMUST00000022469 ObscnA2AAJ9 8891 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc16A0A140LJ72 8478 aa5.15□□□□□ -1.59
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa5.11□□□□□ -1.59
Nisch-201ENSMUST00000022469 Sprr2bO70554 98 aa5.06□□□□□ -1.6
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11554B1AQB2 190 aa5.01□□□□□ -1.61
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa5□□□□□ -1.61
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11555B1AQ89 175 aa4.77□□□□□ -1.65
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap31-2Q8CAY5 177 aa4.5□□□□□ -1.69
Nisch-201ENSMUST00000022469 1110025L11RikO09048 78 aa4.48□□□□□ -1.69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-5Q925H3 78 aa4.48□□□□□ -1.69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Kmt2dQ6PDK2 5588 aa4.47□□□□□ -1.69
Nisch-201ENSMUST00000022469 Macf1Q9QXZ0 7354 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
Nisch-201ENSMUST00000022469 DstQ91ZU6 7393 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
Nisch-201ENSMUST00000022469 Eppk1Q8R0W0 6548 aa4.25□□□□□ -1.73
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm10229O08631 77 aa4.21□□□□□ -1.74
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11568A2A4M2 211 aa4.17□□□□□ -1.74
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap9-1Q64526 186 aa4.17□□□□□ -1.74
Nisch-201ENSMUST00000022469 NebE9Q1W3 7152 aa4.11□□□□□ -1.75
Nisch-201ENSMUST00000022469 Phgr1Q8K0G7 91 aa4.03□□□□□ -1.76
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11559Q9D3H7 191 aa4.01□□□□□ -1.77
Nisch-201ENSMUST00000022469 Muc19Q6PZE0 7524 aa4□□□□□ -1.77
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-2Q9D5Z7 189 aa3.82□□□□□ -1.8
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11639A0A1D5RLM8 5808 aa3.69□□□□□ -1.82
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm4553A0A1B0GSA9 284 aa3.55□□□□□ -1.84
Nisch-201ENSMUST00000022469 Hmcn1D3YXG0 5634 aa3.51□□□□□ -1.85
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gpr98Q8VHN7 6298 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm10153A0A1B0GRL1 320 aa3.41□□□□□ -1.86
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm2431E9Q8S1 172 aa3.38□□□□□ -1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap6-2O08884 159 aa3.36□□□□□ -1.87
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap21-1Q925H4 128 aa3.23□□□□□ -1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm45337A0A1B0GS71 263 aa3.22□□□□□ -1.89
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm40460A0A1B0GR10 244 aa3.17□□□□□ -1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7579A0A1B0GRJ4 243 aa3.17□□□□□ -1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-5Q2TA51 241 aa3.17□□□□□ -1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-4Q62220 223 aa3.17□□□□□ -1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VJH8 109 aa3.17□□□□□ -1.9
Nisch-201ENSMUST00000022469 AhnakE9Q616 5656 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa3.13□□□□□ -1.91
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm11567Q9D141 195 aa2.97□□□□□ -1.93
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm39115A0A1B0GSH7 232 aa2.9□□□□□ -1.94
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VLE6 161 aa2.7□□□□□ -1.98
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm45618A0A1B0GSA0 219 aa2.43□□□□□ -2.02
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm29735A0A1B0GT06 219 aa2.4□□□□□ -2.03
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap5-1Q64507 230 aa1.73□□□□□ -2.13
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A1Y7VJ07 166 aa1.72□□□□□ -2.13
Nisch-201ENSMUST00000022469 A0A286YCP9 139 aa1.55□□□□□ -2.16
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa1.26□□□□□ -2.21
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm4559A4IF42 199 aa1.25□□□□□ -2.21
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030003K21RikA0A1Y7VIM3 128 aa1.22□□□□□ -2.21
Nisch-201ENSMUST00000022469 Krtap28-13A0A087WQP5 138 aa1.15□□□□□ -2.23
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030014E15RikA0A1Y7VJV2 120 aa1.13□□□□□ -2.23
Nisch-201ENSMUST00000022469 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa1.09□□□□□ -2.23
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa0.94□□□□□ -2.26
Nisch-201ENSMUST00000022469 Gm6217A0A1Y7VJK9 128 aa0.93□□□□□ -2.26
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