RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523263.1

VIRMA-208, Transcript of vir like m6A methyltransferase associated, human

TSL 3

Gene VIRMA, Length 609 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VIRMA-208	ENST00000523263	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		11.68	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	AK9	Q5TCS8	1911 aa		11.68	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	HOXC6	P09630	235 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	PLCG2	P16885	1265 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	KCNA4	P22459	653 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	PPP4C	P60510	307 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	MTX1	Q13505	466 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	PORCN	Q9H237	461 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.67	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	ANP32C	O43423	234 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	BAG3	O95817	575 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	IGHA2	P01877	340 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	CCNA1	P78396	465 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	CCL14	Q16627	93 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	LBX2	Q6XYB7	198 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	LPAR1	Q92633	364 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	DNAJC18	Q9H819	358 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.66	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	DNM1L	O00429	736 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	JAG1	P78504	1218 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	TFCP2	Q12800	502 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
VIRMA-208	ENST00000523263	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.65	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263		A0A0C4DFX4	3053 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PEX10	O60683	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PTPRE	P23469	700 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		11.64	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L15	C9J2P7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L11	C9JVI0	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L18	D6R9N7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L22	D6RA61	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L19	D6RCP7	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L20	D6RJB6	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	CNMD	O75829	334 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	GNAI3	P08754	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP17L24	Q0WX57	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SNX17	Q15036	470 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	FLT1	P17948	1338 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	SRGAP3	O43295	1099 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	MCAM	P43121	646 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	USP14	P54578	494 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	RTP1	P59025	263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	GRB14	Q14449	540 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	CERS3	Q8IU89	383 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.62	□□□□□ -0.55
VIRMA-208	ENST00000523263	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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