RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CSAD	Q9Y600	493 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CAP2	P40123	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ASPA	P45381	313 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	DYM	Q7RTS9	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ISL2	Q96A47	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	DNAJA2	O60884	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	HTR3B	O95264	441 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	IMPDH2	P12268	514 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GRK4	P32298	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PDE4B	Q07343	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SGO2	Q562F6	1265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ARMC5	Q96C12	935 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SHD	Q96IW2	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	FBRS	Q9HAH7	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PPT2	Q9UMR5	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PGR	P06401	933 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PLCG1	P19174	1290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MCM4	P33991	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GIPR	P48546	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GDF11	O95390	407 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	BMP3	P12645	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GATA4	P43694	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	NKG7	Q16617	165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	HID1	Q8IV36	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	GMIP	Q9P107	970 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	RAB6A	P20340	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	USP11	P51784	963 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SLC6A19	Q695T7	634 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	PICK1	Q9NRD5	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATRX-223	ENST00000637175	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	PROC	P04070	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	NFIC	P08651	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATRX-223	ENST00000637175	ATP2B1	P20020	1258 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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