RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 LRSAM1Q6UWE0 723 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-204ENST00000587718 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 VPS37DQ86XT2 251 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-204ENST00000587718 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.88■■■□□ 2.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-204ENST00000587718 ADORA1P30542 326 aa29.85■■■□□ 2.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZUG5 572 aa29.84■■■□□ 2.37
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CAPNS1-204ENST00000587718 KRT85P78386 507 aa29.81■■■□□ 2.36
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CAPNS1-204ENST00000587718 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS22Q8NE09 1264 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 E7EWF7 191 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R2C6 588 aa29.8■■■□□ 2.36
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