RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556037.1

AKAP6-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 6, human

TSL 2

Gene AKAP6, Length 582 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP6-208	ENST00000556037	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PDLIM1	O00151	329 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ATP9B	O43861	1147 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	KRT38	O76015	456 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SASH1	O94885	1247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MYL1	P05976	194 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MME	P08473	750 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SKI	P12755	728 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ENPP1	P22413	925 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ELF1	P32519	619 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	DDIT3	P35638	169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CORO7	P57737	925 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ZBED6	P86452	979 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	IQCB1	Q15051	598 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	POSTN	Q15063	836 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	GLMN	Q92990	594 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	NACA2	Q9H009	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.37	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	POM121C	A8CG34	1229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	NEBL	O76041	1014 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	TRIM37	O94972	964 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	NID1	P14543	1247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CYP11B2	P19099	503 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	USP11	P51784	963 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	NUCB2	P80303	420 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	FXN	Q16595	210 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	FAM182B	Q5T319	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	GBP4	Q96PP9	640 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	MDFI	Q99750	246 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	HCN2	Q9UL51	889 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		4.36	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037		M0R082	166 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AKAP6-208	ENST00000556037	BACH1	O14867	736 aa		4.35	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms