RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
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CASP9-211ENST00000546969 BCL11AQ9H165 835 aa20.58■□□□□ 0.89
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CASP9-211ENST00000546969 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.57■□□□□ 0.88
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CASP9-211ENST00000546969 GINM1Q9NU53 330 aa20.55■□□□□ 0.88
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CASP9-211ENST00000546969 FAM196BA6NMK8 535 aa20.54■□□□□ 0.88
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CASP9-211ENST00000546969 MIGA1Q8NAN2 632 aa20.53■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
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CASP9-211ENST00000546969 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.53■□□□□ 0.88
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CASP9-211ENST00000546969 TTC6Q86TZ1 520 aa20.52■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 RAET1EQ8TD07 263 aa20.52■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 PALD1Q9ULE6 856 aa20.52■□□□□ 0.88
CASP9-211ENST00000546969 CYP2C8P10632 490 aa20.51■□□□□ 0.87
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CASP9-211ENST00000546969 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.5■□□□□ 0.87
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CASP9-211ENST00000546969 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 C19orf81C9J6K1 198 aa20.48■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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CASP9-211ENST00000546969 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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CASP9-211ENST00000546969 WDR18Q9BV38 432 aa20.48■□□□□ 0.87
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CASP9-211ENST00000546969 MYPNQ86TC9 1320 aa20.48■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.48■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 PDE6AP16499 860 aa20.47■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 CABP5Q9NP86 173 aa20.47■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.47■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 USP17L10C9JJH3 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 ATP5JP18859 108 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 CAP1Q01518 475 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 COA7Q96BR5 231 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 EHD4Q9H223 541 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.46■□□□□ 0.87
CASP9-211ENST00000546969 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CASP9-211ENST00000546969 GDF11O95390 407 aa20.45■□□□□ 0.86
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CASP9-211ENST00000546969 BACE1P56817 501 aa20.45■□□□□ 0.86
CASP9-211ENST00000546969 UBXN2AP68543 259 aa20.45■□□□□ 0.86
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