RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	PTPRC	P08575	1304 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	TIMM10	P62072	90 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIB2	Q92519	343 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCF2	Q9UG63	623 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	FBXO3	Q9UK99	471 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	PFAS	O15067	1338 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	CYP2B6	P20813	491 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	HMGCS2	P54868	508 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MKNK1-222	ENST00000529170	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	COL6A1	P12109	1028 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	CAP2	P40123	477 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	JAG1	P78504	1218 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MECOM	Q03112	1051 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170		Q3C1V9	767 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	LHX8	Q68G74	356 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	USP6NL	Q92738	828 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	XAGE2	Q96GT9	111 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1B0GUL7	405 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PI16	Q6UXB8	463 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MIER1	Q8N108	512 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	BACE1	P56817	501 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	TFCP2	Q12800	502 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	CCL14	Q16627	93 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	GUCD1	Q96NT3	240 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	PORCN	Q9H237	461 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	LDHC	P07864	332 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	HERVK_113	P62684	666 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	SLFN5	Q08AF3	891 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MTMR2	Q13614	643 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MORN1	Q5T089	497 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	MEIS3	Q99687	375 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	DNAJC18	Q9H819	358 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170		E9PSI1	815 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
MKNK1-222	ENST00000529170	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76

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