RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.39□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFB5O43674 189 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PHACTR2O75167 634 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF21O75509 655 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 TIAF1O95411 115 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 EDN3P14138 238 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 RXRBP28702 533 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 EHHADHQ08426 723 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ORC1Q13415 861 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CITED4Q96RK1 184 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ATG3Q9NT62 314 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 RNF114Q9Y508 228 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 STRCQ7RTU9 1775 aa6.38□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SYNMO15061 1565 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 TNRQ92752 1358 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 F13BP05160 661 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 USP26Q9BXU7 913 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.37□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 MED14O60244 1454 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 DLGAP3O95886 979 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 NFKBIBQ15653 356 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 GGT6Q6P531 493 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 FBXL6Q8N531 539 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.36□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 LMTK2Q8IWU2 1503 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 KIF3BO15066 747 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 FOSL1P15407 271 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 USP5P45974 858 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PLCB3Q01970 1234 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 PAOXQ6QHF9 649 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 GIPC2Q8TF65 315 aa6.35□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRL2O95490 1459 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 KIF15Q9NS87 1388 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 DRD2P14416 443 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ERCC3P19447 782 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 USP11P51784 963 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 MSMPQ1L6U9 139 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 TMC1Q8TDI8 760 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 ABCC3O15438 1527 aa6.34□□□□□ -1.39
HDAC2-216ENST00000523628 TOM1O60784 492 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 HSPA2P54652 639 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 GSTM4Q03013 218 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 COL19A1Q14993 1142 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PI16Q6UXB8 463 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ABI1Q8IZP0 508 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 SHISA5Q8N114 240 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CSRNP1Q96S65 589 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EID1Q9Y6B2 187 aa6.33□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 LTBP4Q8N2S1 1624 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 SLIT1O75093 1534 aa6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HDAC2-216ENST00000523628 PRNPP04156 253 aa6.32□□□□□ -1.4
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