RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MSL1Q68DK7 614 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF804AQ7Z570 1209 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 VGLL2Q8N8G2 317 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM87BQ96K49 555 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 STX8Q9UNK0 236 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PRDX5P30044 214 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ST3GAL1Q11201 340 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MTA1Q13330 715 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SPC24Q8NBT2 197 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF3Q9H094 633 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BAG3O95817 575 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 LIG1P18858 919 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ATP2B2Q01814 1243 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PPARAQ07869 468 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC91Q7Z6B0 441 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RASSF8Q8NHQ8 419 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 FGFR2P21802 821 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KLRK1P26718 216 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PDE4BQ07343 736 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 APOA5Q6Q788 366 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RINLQ6ZS11 566 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 AIFM3Q96NN9 605 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 USP28Q96RU2 1077 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CYB5R4Q7L1T6 521 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM5Q9C035 493 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GGA1Q9UJY5 639 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KLHL33A6NCF5 533 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GSG1L2A8MUP6 293 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 LDHCP07864 332 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TNNT1P13805 278 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BIRC2Q13490 618 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 JMYQ8N9B5 988 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 WASF1Q92558 559 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD23Q86SG2 305 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-208ENST00000519076 NEDD4P46934 1319 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-208ENST00000519076 CASQ1P31415 396 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 MECOMQ03112 1051 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 PICALMQ13492 652 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DIXDC1Q155Q3 683 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CARMIL3Q8ND23 1372 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ABCC12Q96J65 1359 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TMX1Q9H3N1 280 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BCL2L12Q9HB09 334 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1B0GVL5 298 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BIN1O00499 593 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TNKSO95271 1327 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ERICH4A6NGS2 130 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 NRDCO43847 1150 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 TXNRD1Q16881 649 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 KRT40Q6A162 431 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ISM2Q6H9L7 571 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD7Q92527 254 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 DEF6Q9H4E7 631 aa8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 SPTLC2O15270 562 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 NR1I2O75469 434 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF165P49910 485 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 ANTXR2P58335 489 aa8.98□□□□□ -0.97
TRPS1-208ENST00000519076 GRAPQ13588 217 aa8.98□□□□□ -0.97
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