RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455631.5

PTPRA-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, human

TSL 5

Gene PTPRA, Length 1,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	ANP32C	O43423	234 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	TBC1D12	O60347	775 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	HMGCS2	P54868	508 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	TDH	Q8IZJ6	230 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	PLXNB2	O15031	1838 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PTPRA-208	ENST00000455631	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631		A0A0C4DFX4	3053 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF521	Q96K83	1311 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	ZBTB22	O15209	634 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	RHBDL3	P58872	404 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	TRIB2	Q92519	343 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	MECOM	Q03112	1051 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	CYP2B6	P20813	491 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	TIMM10	P62072	90 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	PFAS	O15067	1338 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	CAP2	P40123	477 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRA-208	ENST00000455631	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	USP17L5	A8MUK1	530 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		28.76	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	ZNF384	Q8TF68	577 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	COPRS	Q9NQ92	184 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.75	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631		A0A1B0GUL7	405 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	MTMR2	Q13614	643 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	XAGE2	Q96GT9	111 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	GSTO1	P78417	241 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631		E9PSI1	815 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	PEX10	O60683	326 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	LDHC	P07864	332 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		28.72	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPRA-208	ENST00000455631	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	PI16	Q6UXB8	463 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	TEX11	Q8IYF3	940 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	RAI14	Q9P0K7	980 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	SIPA1L1	O43166	1804 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	COL6A1	P12109	1028 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	TFCP2	Q12800	502 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	BACE1	P56817	501 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	HERVK_113	P62684	666 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	SPATA5	Q8NB90	893 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	WDR18	Q9BV38	432 aa		28.68	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	MAPK4	P31152	587 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	ASNS	P08243	561 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	MEIS3	Q99687	375 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRA-208	ENST00000455631	RGS2	P41220	211 aa		28.65	■■■□□ 2.18

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