RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 GCHFRP30047 84 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 Q5BKY6 102 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 PYY3Q5JQD4 70 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 BAGE2Q86Y30 109 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 CNFNQ9BYD5 112 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.41□□□□□ -2.34
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WVE0 104 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 K7EP34 96 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 COX6CP09669 75 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SERP2Q8N6R1 65 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SMIM11BQ8TCY0 68 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 PRR15LQ9BU68 103 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 HIGD1BQ9P298 99 aa0.4□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 A0A087WXM4 84 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 H7BZZ5 65 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 UQCR11O14957 56 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 NDUFC1O43677 76 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 PEA15Q15121 130 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 PMCHL1Q16048 86 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 Q6JHZ5 121 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.39□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 A0A0D9SG42 100 aa0.38□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 LINC00158P58513 81 aa0.38□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.38□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.38□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 LEPROTL1O95214 131 aa0.37□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 ETDBQ3ZM63 59 aa0.37□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 SPCS1Q9Y6A9 102 aa0.37□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 GNGT1P63211 74 aa0.36□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 MUSTN1Q8IVN3 82 aa0.36□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 M0QZ58 72 aa0.35□□□□□ -2.35
RRN3-204ENST00000561685 A0A1B0GU69 56 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 IGIPA6NJ69 53 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 H0Y9P7 68 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 H3BUT2 72 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 SMIM13P0DJ93 91 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 COX7BP24311 80 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 ADIRFQ15847 76 aa0.34□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa0.33□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 IGLC3P0DOY3 106 aa0.33□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 LINC00643Q86TS7 51 aa0.33□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 A0A1B0GUT8 65 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 SERF2P84101 59 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 SPATA8Q6RVD6 105 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.32□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa0.31□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 LINC01546A6NGU7 62 aa0.3□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 ACYP1P07311 99 aa0.3□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 K7EMI3 77 aa0.29□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.29□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 C18orf32Q8TCD1 76 aa0.28□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 SMCO4Q9NRQ5 59 aa0.28□□□□□ -2.36
RRN3-204ENST00000561685 UMAD1C9J7I0 102 aa0.27□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 LINC01549A6NIU2 74 aa0.26□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 NREPQ16612 68 aa0.26□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa0.26□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 NDUFB1O75438 58 aa0.25□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 COX8AP10176 69 aa0.25□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 GNG13Q9P2W3 67 aa0.25□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 ATXN8Q156A1 80 aa0.22□□□□□ -2.37
RRN3-204ENST00000561685 LINC00308Q8TCZ7 52 aa0.21□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 S100ZQ8WXG8 99 aa0.21□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa0.2□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.2□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 UBL5Q9BZL1 73 aa0.19□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 PRM1P04553 51 aa0.17□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 TNP1P09430 55 aa0.17□□□□□ -2.38
RRN3-204ENST00000561685 PLNP26678 52 aa0.13□□□□□ -2.39
RRN3-204ENST00000561685 H0YGX0 51 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.2 ms