RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BCP62807 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATXN8Q156A1 80 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BHQ93079 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BNQ99877 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BMQ99879 126 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.73□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BJP06899 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BOP23527 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST1H2BBP33778 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 PMCHL1Q16048 86 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST2H2BEQ16778 126 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMIM20Q8N5G0 67 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRO1854Q9UHT4 67 aa-0.74□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 EFCAB10A6NFE3 127 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 TPM2P07951 284 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 FUNDC1Q8IVP5 155 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HIST3H2BBQ8N257 126 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP-0.75□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-0.76□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SSNA1O43805 119 aa-0.76□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.76□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC51BQ86UW2 128 aa-0.76□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.76□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNGT2O14610 69 aa-0.77□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 TPM1P09493 284 aa-0.77□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 PET100P0DJ07 73 aa-0.77□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 TPM4P67936 248 aa-0.77□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 DR1Q01658 176 aa-0.77□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
PDCL2P1-201ENST00000419302 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-0.79□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 TPM3P06753 285 aa-0.79□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.79□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 CCDC167Q9P0B6 97 aa-0.79□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMLR1H3BR10 107 aa-0.8□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 S100A6P06703 90 aa-0.8□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 GNG11P61952 73 aa-0.8□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 C12orf73Q69YU5 71 aa-0.8□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.8□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A1B0GV50 99 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 BANF1O75531 89 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADIRFQ15847 76 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 CROCCP2Q86T23 111 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 LINC00643Q86TS7 51 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 Q9H521 79 aa-0.81□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM25AB3EWG3 89 aa-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM25CB3EWG5 89 aa-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM25GB3EWG6 89 aa-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.82□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPA17Q15506 151 aa-0.83□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.83□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 TOMM5Q8N4H5 51 aa-0.83□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 C9orf16Q9BUW7 83 aa-0.83□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 DLEU1O43261 78 aa-0.84□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 PMAIP1Q13794 54 aa-0.84□□□□□ -2.54
PDCL2P1-201ENST00000419302 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 K7ERJ3 54 aa-0.87□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 J3QR89 54 aa-0.88□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 SVBPQ8N300 66 aa-0.88□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 M0R143 59 aa-0.89□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 PYY3Q5JQD4 70 aa-0.89□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 C14orf144Q96I85 54 aa-0.89□□□□□ -2.55
PDCL2P1-201ENST00000419302 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.91□□□□□ -2.56
PDCL2P1-201ENST00000419302 K7ERU9 68 aa-0.93□□□□□ -2.56
PDCL2P1-201ENST00000419302 A0A1B0GV90 55 aa-1.08□□□□□ -2.58
PDCL2P1-201ENST00000419302 PTMSP20962 102 aa-1.09□□□□□ -2.58
PDCL2P1-201ENST00000419302 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa-1.31□□□□□ -2.62
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms