RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598128.5

LINC00854-208, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	COL7A1	Q02388	2944 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.17	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.15	□□□□□ -1.74
LINC00854-208	ENST00000598128		A0A0D9SG42	100 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.13	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.09	□□□□□ -1.75
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.09	□□□□□ -1.76
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.06	□□□□□ -1.76
LINC00854-208	ENST00000598128	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.05	□□□□□ -1.76
LINC00854-208	ENST00000598128	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4	□□□□□ -1.77
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH2	Q9P225	4427 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
LINC00854-208	ENST00000598128		R4GN34	69 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	KMT2A	Q03164	3969 aa		3.95	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		3.94	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		3.93	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.93	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LINC00854-208	ENST00000598128	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.89	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.88	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	PKHD1	P08F94	4074 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128		A0A1B0GVY2	172 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	PKD1	P98161	4303 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.85	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	INE1	O15225	51 aa		3.84	□□□□□ -1.79
LINC00854-208	ENST00000598128	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.82	□□□□□ -1.8
LINC00854-208	ENST00000598128	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
LINC00854-208	ENST00000598128	TNP1	P09430	55 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LINC00854-208	ENST00000598128		Q5VSD8	79 aa		3.76	□□□□□ -1.81
LINC00854-208	ENST00000598128	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
LINC00854-208	ENST00000598128	TNXB	P22105	4242 aa		3.71	□□□□□ -1.81
LINC00854-208	ENST00000598128	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		3.69	□□□□□ -1.82
LINC00854-208	ENST00000598128	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LINC00854-208	ENST00000598128	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.61	□□□□□ -1.83
LINC00854-208	ENST00000598128	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00854-208	ENST00000598128	HSPG2	P98160	4391 aa		3.6	□□□□□ -1.83
LINC00854-208	ENST00000598128	FAT1	Q14517	4588 aa		3.58	□□□□□ -1.84
LINC00854-208	ENST00000598128	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
LINC00854-208	ENST00000598128	MYCBP2	O75592	4640 aa		3.47	□□□□□ -1.85
LINC00854-208	ENST00000598128	DNHD1	Q96M86	4753 aa		3.46	□□□□□ -1.86
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.45	□□□□□ -1.86
LINC00854-208	ENST00000598128	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		3.45	□□□□□ -1.86
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.44	□□□□□ -1.86
LINC00854-208	ENST00000598128	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LINC00854-208	ENST00000598128	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
LINC00854-208	ENST00000598128	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.31	□□□□□ -1.88
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		3.28	□□□□□ -1.88
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	LRP2	P98164	4655 aa		3.25	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	MUC17	Q685J3	4493 aa		3.24	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		3.23	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.22	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	RYR2	Q92736	4967 aa		3.21	□□□□□ -1.89
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.18	□□□□□ -1.9
LINC00854-208	ENST00000598128	RYR1	P21817	5038 aa		3.17	□□□□□ -1.9
LINC00854-208	ENST00000598128	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-5	P60370	271 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LINC00854-208	ENST00000598128	LPA	P08519	4548 aa		3.16	□□□□□ -1.9
LINC00854-208	ENST00000598128	HERC1	Q15751	4861 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LINC00854-208	ENST00000598128	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.07	□□□□□ -1.92
LINC00854-208	ENST00000598128	MT1X	P80297	61 aa		3.06	□□□□□ -1.92
LINC00854-208	ENST00000598128		M0R2T5	61 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	RYR3	Q15413	4870 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MT2A	P02795	61 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MT1B	P07438	61 aa		3	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MT1F	P04733	61 aa		2.97	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	MT1H	P80294	61 aa		2.97	□□□□□ -1.93
LINC00854-208	ENST00000598128	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94

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