RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0G2JQZ4 141 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PNN7 141 aa4.74□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.73□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.72□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.71□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.65
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM168BA1KXE4 195 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 DMAC1Q96GE9 116 aa4.7□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00483Q53H64 154 aa4.69□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV7-43P04211 117 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.68□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 RYR3Q15413 4870 aa4.67□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GVX0 72 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 A8MUU9 505 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 P0C880 135 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 APLNQ9ULZ1 77 aa4.66□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.65□□□□□ -1.66
EFTUD2-218ENST00000590367 K7ERS5 55 aa4.65□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR1BP22528 89 aa4.64□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 PRLHP81277 87 aa4.63□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A096LNI7 61 aa4.62□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 CHTF8P0CG12 524 aa4.61□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 RYR2Q92736 4967 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 C14orf177Q52M58 125 aa4.6□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 NDUFAF8A1L188 74 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.59□□□□□ -1.67
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.58□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM229AH3BQW9 127 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 Q96NJ1 140 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 LUZP6Q538Z0 58 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.54□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 Q5W150 140 aa4.53□□□□□ -1.68
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.52□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV2-30P06310 120 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 PANO1I0J062 215 aa4.5□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 CRIPTQ9P021 101 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A087WTM6 91 aa4.48□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GU33 70 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 SPINK1P00995 79 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.47□□□□□ -1.69
EFTUD2-218ENST00000590367 H0YAA0 97 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.46□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA1109Q2LD37 5005 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1B0GVY2 172 aa4.45□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZSA8 131 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-2P60368 255 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.44□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 KMT2AQ03164 3969 aa4.43□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.42□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.41□□□□□ -1.7
EFTUD2-218ENST00000590367 LYSTQ99698 3801 aa4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.38□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-1P60331 282 aa4.36□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 Q8N1X5 172 aa4.35□□□□□ -1.71
EFTUD2-218ENST00000590367 HERC2O95714 4834 aa4.34□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 Q5VSD8 79 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.33□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 J3QL48 77 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 TPRXLQ17RH7 258 aa4.31□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 RYR1P21817 5038 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.29□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.6 ms