RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITSN1Q15811 1721 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPLO60437 1756 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087WXM4 84 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 WT1-ASQ06250 92 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC37Q6PGP7 1564 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL12A1Q99715 3063 aa-1.48□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPR1Q14643 2758 aa-1.49□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO9AB2RTY4 2548 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRIP1P50238 77 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-1.5□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRBAP50851 2863 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNP1P09430 55 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1XP80297 61 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 HFM1A2PYH4 1435 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-1.51□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 RICTORQ6R327 1708 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-1.52□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST20Q9HBF5 79 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-552P-201ENST00000362869 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM5DQ9BY66 1539 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 TJP1Q07157 1748 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADIRFQ15847 76 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-1.57□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BUT2 72 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIF1AQ12756 1690 aa-1.58□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 S100A13Q99584 98 aa-1.59□□□□□ -2.66
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD163L1Q9NR16 1453 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BUA1 57 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1EP04732 61 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.6□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC1P33527 1531 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRAPQ86VF7 1730 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL6A5A8TX70 2615 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 LY75O60449 1722 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCER1GP30273 86 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNG2P59768 71 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1LQ93083 61 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 C18orf32Q8TCD1 76 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 NHSQ6T4R5 1651 aa-1.67□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED14O60244 1454 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERVK-7P63135 1459 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGAQ8IWI9 3026 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BVH4 76 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 EYSQ5T1H1 3165 aa-1.71□□□□□ -2.68
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC6O95255 1503 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAH5Q8TE73 4624 aa-1.72□□□□□ -2.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0QZ58 72 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-1.74□□□□□ -2.69
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0QY20 66 aa-1.75□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms