RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635310.1

NRXN1-241, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NRXN1, Length 1,246 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-241ENST00000635310 PRLHP81277 87 aa7□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 Q6ZQT0 140 aa7□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 SMCR5Q8TEV8 140 aa7□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 SCGB1A1P11684 91 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 UBE2AP49459 152 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00643Q86TS7 51 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 Q8N377 158 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.99□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 BCE1O60756 84 aa6.98□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.98□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 ERC2-IT1O76042 136 aa6.97□□□□□ -1.29
NRXN1-241ENST00000635310 F8WEM9 126 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00846Q9NV44 126 aa6.96□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 Q6Q795 121 aa6.95□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 Q6JHZ5 121 aa6.94□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 UBL5Q9BZL1 73 aa6.94□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.93□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 LCE6AA0A183 80 aa6.93□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.93□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.92□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.92□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 IMUPQ9GZP8 106 aa6.92□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 PCP4P48539 62 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 Q8N1X5 172 aa6.91□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 SPRR1BP22528 89 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 C1orf137Q5JT78 98 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.9□□□□□ -1.3
NRXN1-241ENST00000635310 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.9□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 A0A1B0GW54 56 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 SMIM29Q86T20 159 aa6.89□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.88□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 Q6ZSA8 131 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 Q8NBF4 154 aa6.87□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 Q6ZVQ6 151 aa6.86□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 SCXQ7RTU7 201 aa6.85□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 PKD1P98161 4303 aa6.85□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 ZNF861PO60384 105 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP10-1P60331 282 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 SPRR4Q96PI1 79 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.84□□□□□ -1.31
NRXN1-241ENST00000635310 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.84□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 A0A1W2PNM2 257 aa6.83□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 IGLV7-43P04211 117 aa6.82□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 CXCL6P80162 114 aa6.82□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 HAMPP81172 84 aa6.82□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 LINC00483Q53H64 154 aa6.82□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 IGFL1Q6UW32 110 aa6.82□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.81□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.81□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 NREPQ16612 68 aa6.81□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 CRYGAP11844 174 aa6.79□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.79□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.79□□□□□ -1.32
NRXN1-241ENST00000635310 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.76□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 A0A087WVE0 104 aa6.75□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 A0A1B0GVY2 172 aa6.75□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 ATOX1O00244 68 aa6.75□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 BPY2O14599 106 aa6.75□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 A0A087WSZ3 146 aa6.74□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 A0A0G2JQZ4 141 aa6.73□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 MOBPQ13875 183 aa6.73□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 RYR2Q92736 4967 aa6.73□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
NRXN1-241ENST00000635310 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.71□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.7□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 IGKV4-1P06312 121 aa6.69□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.68□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 PKHD1P08F94 4074 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 Q8N9L7 120 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.65□□□□□ -1.34
NRXN1-241ENST00000635310 J3KT08 172 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 DSCR10P59022 87 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 CD164Q04900 197 aa6.64□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 UQCRQO14949 82 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 COX7CP15954 63 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 SERP2Q8N6R1 65 aa6.63□□□□□ -1.35
NRXN1-241ENST00000635310 K7EQZ3 153 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms