RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612263.1

WHAMMP3-202, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

TSL 4

Gene WHAMMP3, Length 538 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-202ENST00000612263 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 PRO3102Q9H379 93 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAIMQ9NVQ4 179 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 UQCR10Q9UDW1 63 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 LY75O60449 1722 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIF1AQ12756 1690 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.65□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 NCOA2Q15596 1464 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 TEX14Q8IWB6 1497 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 TJP1Q07157 1748 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 ITSN1Q15811 1721 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
WHAMMP3-202ENST00000612263 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 A0A1B0GV90 55 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 NAP1L6A6NFF2 107 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 IAPPP10997 89 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 SNCAP37840 140 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 LINC00158P58513 81 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PYDC1Q8WXC3 89 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TRGV9Q99603 122 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CGREF1Q99674 301 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 LTN1O94822 1766 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.66□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 SZT2Q5T011 3432 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TCHHQ07283 1943 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TMEM262E9PQX1 116 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 F8WEM9 126 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 J3QR89 54 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CORTO00230 105 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 DLEU1O43261 78 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 MPC2O95563 127 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 C12orf57Q99622 126 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIF20BQ96Q89 1820 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 ATMQ13315 3056 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 DIP2AQ14689 1571 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 DNMBPQ6XZF7 1577 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 RICTORQ6R327 1708 aa-0.67□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TNP1P09430 55 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 C3orf79P0CE67 100 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 AKAIN1P0CW23 69 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TRAPPC2P0DI81 140 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 NMSQ5H8A3 153 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 COPS9Q8WXC6 57 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PFDN5Q99471 154 aa-0.68□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PCNTO95613 3336 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 SPEGQ15772 3267 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 FAM24AA6NFZ4 105 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 GNG4P50150 75 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PPP3R1P63098 170 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 GNGT1P63211 74 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 WT1-ASQ06250 92 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 HMGN3Q15651 99 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 PMCHL1Q16048 86 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 ETDBQ3ZM63 59 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 ALKAL2Q6UX46 152 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 WFDC9Q8NEX5 89 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 C20orf78Q9BR46 151 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 C2orf88Q9BSF0 95 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 ITPR2Q14571 2701 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.69□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 GLI2P10070 1586 aa-0.7□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.7□□□□□ -2.52
WHAMMP3-202ENST00000612263 KIF21BO75037 1637 aa-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms