RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602591.1

HCG18-246, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

Gene HCG18, Length 1,976 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-246ENST00000602591 C8orf87E5RJ46 101 aa7.43□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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HCG18-246ENST00000602591 KLKP1Q107X0 134 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 IGLV6-57P01721 117 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZSA8 131 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 LINC00167Q96N53 147 aa7.42□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 M0R378 163 aa7.41□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG18-246ENST00000602591 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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HCG18-246ENST00000602591 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.39□□□□□ -1.23
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HCG18-246ENST00000602591 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.35□□□□□ -1.23
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HCG18-246ENST00000602591 C20orf197Q8N268 126 aa7.35□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 Q6ZVQ6 151 aa7.34□□□□□ -1.23
HCG18-246ENST00000602591 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.34□□□□□ -1.23
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HCG18-246ENST00000602591 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.34□□□□□ -1.23
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HCG18-246ENST00000602591 Q1T7F1 81 aa7.32□□□□□ -1.24
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HCG18-246ENST00000602591 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.3□□□□□ -1.24
HCG18-246ENST00000602591 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-246ENST00000602591 REG3GQ6UW15 175 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-246ENST00000602591 LCA10Q71F78 164 aa7.29□□□□□ -1.24
HCG18-246ENST00000602591 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.29□□□□□ -1.24
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HCG18-246ENST00000602591 DIRC1Q969H9 104 aa7.28□□□□□ -1.24
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HCG18-246ENST00000602591 CXCL6P80162 114 aa7.19□□□□□ -1.26
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HCG18-246ENST00000602591 IGLV7-43P04211 117 aa7.18□□□□□ -1.26
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HCG18-246ENST00000602591 CDK2AP2O75956 126 aa7.16□□□□□ -1.26
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HCG18-246ENST00000602591 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 MP68P56378 58 aa7.11□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 hDV103S1A0JD37 113 aa7.1□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 SMIM29Q86T20 159 aa7.09□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HCG18-246ENST00000602591 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.09□□□□□ -1.27
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