RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 SCGB1A1P11684 91 aa3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.34□□□□□ -1.87
CKAP5-211ENST00000532321 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 A0A1B0GW54 56 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 BCE1O60756 84 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00643Q86TS7 51 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 Q9BRP9 147 aa3.33□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.32□□□□□ -1.88
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CKAP5-211ENST00000532321 Q6ZQT0 140 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 Q8N377 158 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 IMUPQ9GZP8 106 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.32□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 LCE6AA0A183 80 aa3.31□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 F8WEM9 126 aa3.31□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 Q6Q795 121 aa3.31□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 UBL5Q9BZL1 73 aa3.31□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 PANO1I0J062 215 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 ERC2-IT1O76042 136 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 MT-ATP8P03928 68 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 SPRR1BP22528 89 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 XGP55808 180 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 PRLHP81277 87 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 Q6JHZ5 121 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00846Q9NV44 126 aa3.29□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.28□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 A0A1B0GV72 72 aa3.28□□□□□ -1.88
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CKAP5-211ENST00000532321 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.28□□□□□ -1.88
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CKAP5-211ENST00000532321 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.28□□□□□ -1.88
CKAP5-211ENST00000532321 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.27□□□□□ -1.89
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CKAP5-211ENST00000532321 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
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CKAP5-211ENST00000532321 PCP4P48539 62 aa3.25□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 KRTAP10-1P60331 282 aa3.25□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 CXCL6P80162 114 aa3.25□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00483Q53H64 154 aa3.25□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 Q6ZVQ6 151 aa3.25□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 SPRR4Q96PI1 79 aa3.25□□□□□ -1.89
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CKAP5-211ENST00000532321 SCXQ7RTU7 201 aa3.24□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.24□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 KMT2AQ03164 3969 aa3.23□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.23□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 A0A1W2PNM2 257 aa3.23□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 BPY2O14599 106 aa3.22□□□□□ -1.89
CKAP5-211ENST00000532321 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.21□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.21□□□□□ -1.9
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CKAP5-211ENST00000532321 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 A0A1B0GVY2 172 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 ATOX1O00244 68 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.2□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 A0A087WSZ3 146 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 J3KT08 172 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 CD164Q04900 197 aa3.19□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.18□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.18□□□□□ -1.9
CKAP5-211ENST00000532321 MOBPQ13875 183 aa3.17□□□□□ -1.9
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