RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498171.5

DGCR8-210, Transcript of DGCR8, microprocessor complex subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DGCR8, Length 3,661 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR8-210ENST00000498171 VPREB1P12018 145 aa7.49□□□□□ -1.21
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DGCR8-210ENST00000498171 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.48□□□□□ -1.21
DGCR8-210ENST00000498171 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.47□□□□□ -1.21
DGCR8-210ENST00000498171 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
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DGCR8-210ENST00000498171 Q8NBF4 154 aa7.46□□□□□ -1.22
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DGCR8-210ENST00000498171 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.45□□□□□ -1.22
DGCR8-210ENST00000498171 Q8NAQ8 132 aa7.45□□□□□ -1.22
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DGCR8-210ENST00000498171 CASC10Q5T4H9 136 aa7.07□□□□□ -1.28
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DGCR8-210ENST00000498171 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.04□□□□□ -1.28
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DGCR8-210ENST00000498171 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 UQCR11O14957 56 aa6.99□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 ZNF861PO60384 105 aa6.99□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.99□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
DGCR8-210ENST00000498171 ACYP2P14621 99 aa6.98□□□□□ -1.29
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