RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 H3BNG1 76 aa8.85□□□□□ -0.99
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RABGEF1-210ENST00000437078 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RABGEF1-210ENST00000437078 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.82□□□□□ -1
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RABGEF1-210ENST00000437078 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.67□□□□□ -1.02
RABGEF1-210ENST00000437078 C14orf177Q52M58 125 aa8.67□□□□□ -1.02
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RABGEF1-210ENST00000437078 C16orf90A8MZG2 172 aa8.65□□□□□ -1.03
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RABGEF1-210ENST00000437078 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.63□□□□□ -1.03
RABGEF1-210ENST00000437078 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.63□□□□□ -1.03
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RABGEF1-210ENST00000437078 A8MU10 97 aa8.61□□□□□ -1.03
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RABGEF1-210ENST00000437078 K7EQZ3 153 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-210ENST00000437078 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.55□□□□□ -1.04
RABGEF1-210ENST00000437078 RTL8CO15255 209 aa8.55□□□□□ -1.04
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RABGEF1-210ENST00000437078 LYSTQ99698 3801 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGEF1-210ENST00000437078 DSCR10P59022 87 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGEF1-210ENST00000437078 SPINK7P58062 85 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-210ENST00000437078 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.36□□□□□ -1.07
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