RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.88□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.87□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZQY7 126 aa8.87□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 H3BQ85 93 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 TENM2Q9NT68 2774 aa8.86□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.85□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 C16orf90A8MZG2 172 aa8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
FCHO1-221ENST00000597512 A0A096LNI7 61 aa8.83□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 PRYO14603 147 aa8.83□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 GHRHP01286 108 aa8.83□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.83□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 M0R2N4 97 aa8.82□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.81□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.81□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR1AP35321 89 aa8.8□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 CCKP06307 115 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.79□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00643Q86TS7 51 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZRX8 168 aa8.78□□□□□ -1
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1W2PNN7 141 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.77□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 IMUPQ9GZP8 106 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZR54 194 aa8.76□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 REG3GQ6UW15 175 aa8.75□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 CHTF8P0CG12 524 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 DSCR8Q96T75 97 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 Q9BRP9 147 aa8.74□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 Q6ZQT0 140 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00846Q9NV44 126 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 A0A087WTM6 91 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 UQCRQO14949 82 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 FBN3Q75N90 2809 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.71□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 PDE6GP18545 87 aa8.71□□□□□ -1.01
FCHO1-221ENST00000597512 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 LY6G6CO95867 125 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 UBE2BP63146 152 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 A0A087WVE0 104 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 Q8N377 158 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 COX7CP15954 63 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 KMT2AQ03164 3969 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 ERC2-IT1O76042 136 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 Q6JHZ5 121 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 PANO1I0J062 215 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-221ENST00000597512 RTL8CO15255 209 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 DPH3Q96FX2 82 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 DNAH2Q9P225 4427 aa8.65□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 UBL5Q9BZL1 73 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 PRLHP81277 87 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 ATOX1O00244 68 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 CRYGAP11844 174 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 EPM2AB3EWF7 344 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 J3KT08 172 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 H0Y9J4 135 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 TGP01266 2768 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 C3orf84H3BNL1 204 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-221ENST00000597512 TNP2Q05952 138 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-221ENST00000597512 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms