RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 A0A0J9YWU9 116 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 C6orf99Q4VX62 202 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 LELP1Q5T871 98 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 SCXQ7RTU7 201 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 H0YGX0 51 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-205ENST00000587860 ESRGQ1W209 222 aa10.07□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 M0R2N4 97 aa10.06□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 PSPHP1O15172 72 aa10.06□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 C6orf48Q9UBA6 75 aa10.06□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.04□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 PRR34Q9NV39 138 aa10.03□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa10.03□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.03□□□□□ -0.8
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZRU5 148 aa10.03□□□□□ -0.8
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CTIF-205ENST00000587860 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.01□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 A8MU10 97 aa10.01□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 NREPQ16612 68 aa10□□□□□ -0.81
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZVQ6 151 aa9.99□□□□□ -0.81
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CTIF-205ENST00000587860 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.96□□□□□ -0.81
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZQY7 126 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 C15orf56Q8N910 161 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 Q8N9L7 120 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 PRYO14603 147 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZRP5 223 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 BPY2O14599 106 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.93□□□□□ -0.82
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CTIF-205ENST00000587860 Q6ZQT0 140 aa9.91□□□□□ -0.82
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CTIF-205ENST00000587860 K7EIL1 84 aa9.83□□□□□ -0.84
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CTIF-205ENST00000587860 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.74□□□□□ -0.85
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CTIF-205ENST00000587860 DNAH7Q8WXX0 4024 aa9.73□□□□□ -0.85
CTIF-205ENST00000587860 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
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CTIF-205ENST00000587860 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.71□□□□□ -0.85
CTIF-205ENST00000587860 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.71□□□□□ -0.85
CTIF-205ENST00000587860 C3orf84H3BNL1 204 aa9.71□□□□□ -0.86
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