RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
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CAPNS1-204ENST00000587718 DNAH11Q96DT5 4516 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 M0R378 163 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 VPREB1P12018 145 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00588Q9Y4M8 146 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 GHRHP01286 108 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SYCNQ0VAF6 134 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TLX1NBP0CAT3 122 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa16.64■□□□□ 0.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 DIRC1Q969H9 104 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa16.64■□□□□ 0.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-204ENST00000587718 XAGE1AQ9HD64 81 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-204ENST00000587718 SLPIP03973 132 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-204ENST00000587718 GAGE2AQ6NT46 116 aa16.61■□□□□ 0.25
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf132Q9NPU4 83 aa16.58■□□□□ 0.24
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CAPNS1-204ENST00000587718 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SMCR5Q8TEV8 140 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZRP5 223 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa16.5■□□□□ 0.23
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC13Q9BS18 74 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RYR1P21817 5038 aa16.5■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 USP17L23D6RBM5 183 aa16.48■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6JHZ5 121 aa16.47■□□□□ 0.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KCNQ1DNQ9H478 68 aa16.45■□□□□ 0.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 NKAPP1Q8N9T2 125 aa16.44■□□□□ 0.22
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CAPNS1-204ENST00000587718 LINC00846Q9NV44 126 aa16.42■□□□□ 0.22
CAPNS1-204ENST00000587718 C16orf90A8MZG2 172 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP1BQ9NZR2 4599 aa16.41■□□□□ 0.22
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPG2P98160 4391 aa16.39■□□□□ 0.21
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CAPNS1-204ENST00000587718 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZQT0 140 aa16.38■□□□□ 0.21
CAPNS1-204ENST00000587718 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa16.37■□□□□ 0.21
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK2AP2O75956 126 aa16.37■□□□□ 0.21
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CAPNS1-204ENST00000587718 C7orf33Q8WU49 177 aa16.35■□□□□ 0.21
CAPNS1-204ENST00000587718 DSCR8Q96T75 97 aa16.34■□□□□ 0.21
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CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf177Q52M58 125 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SPRR1AP35321 89 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CNBPP62633 177 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 UBL5Q9BZL1 73 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa16.3■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa16.29■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa16.28■□□□□ 0.2
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.27■□□□□ 0.19
CAPNS1-204ENST00000587718 APOBP04114 4563 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.25■□□□□ 0.19
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
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CAPNS1-204ENST00000587718 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 B5MCH6 92 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ATOX1O00244 68 aa16.2■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8N1X5 172 aa16.18■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PSCAO43653 123 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa16.17■□□□□ 0.18
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1B0GW54 56 aa16.14■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087WTM6 91 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM168BA1KXE4 195 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCL6P80162 114 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC179H3BU77 68 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZVQ6 151 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 Q8N377 158 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL37AP8A6NKH3 93 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 UQCRQO14949 82 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 REG3GQ6UW15 175 aa16.08■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 BCE1O60756 84 aa16.07■□□□□ 0.16
CAPNS1-204ENST00000587718 Q9BRP9 147 aa16.07■□□□□ 0.16
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