RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 S100A12P80511 92 aa8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 C12orf57Q99622 126 aa8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.7□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.69□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 SPINK1P00995 79 aa8.69□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 MOBPQ13875 183 aa8.69□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 ERC2-IT1O76042 136 aa8.68□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 LINC00483Q53H64 154 aa8.68□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 ATOH7Q8N100 152 aa8.67□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 Q8N377 158 aa8.65□□□□□ -1.02
NME3-211ENST00000568561 B5MCH6 92 aa8.64□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.64□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 E9PLD3 99 aa8.63□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 HERVK_113P61574 105 aa8.63□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 Q9BRP9 147 aa8.63□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.62□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.62□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 HERV-K104P63124 156 aa8.62□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.62□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 VAMP8Q9BV40 100 aa8.61□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.6□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 LEPROTO15243 131 aa8.6□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 DDTP30046 118 aa8.6□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 TSTD3H0UI37 97 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 SLC25A20O43772 301 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 XP32Q5T750 250 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 Q6ZRX8 168 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.59□□□□□ -1.03
NME3-211ENST00000568561 SPATA45Q537H7 98 aa8.58□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.58□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 LINC00587B1AMM8 73 aa8.57□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 J3QQQ9 107 aa8.57□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 LCE2CQ5TA81 110 aa8.56□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.55□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 NMUP48645 174 aa8.55□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.55□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 COX8AP10176 69 aa8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 PCP2Q8IVA1 136 aa8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 DLEU1O43261 78 aa8.53□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 NPC2P61916 151 aa8.53□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.53□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.53□□□□□ -1.04
NME3-211ENST00000568561 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.52□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 IGLV6-57P01721 117 aa8.52□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.52□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.51□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 C14orf144Q96I85 54 aa8.51□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF815PA8K554 130 aa8.5□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.5□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.49□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 C9orf92A6NGG3 77 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 NDUFC2O95298 119 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 PCOTHQ58A44 107 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 PRO1933Q9H354 126 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.48□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 A0A0J9YXY3 114 aa8.47□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 MT1HP80294 61 aa8.47□□□□□ -1.05
NME3-211ENST00000568561 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.46□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 TIMM17BO60830 172 aa8.46□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.46□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.45□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 HIGD1BQ9P298 99 aa8.45□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.44□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 LITAFQ99732 161 aa8.44□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 LIMD2Q9BT23 127 aa8.42□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 SPRR1BP22528 89 aa8.4□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.4□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.4□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 SPANXCQ9NY87 97 aa8.4□□□□□ -1.06
NME3-211ENST00000568561 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 Q6ZVH6 145 aa8.39□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 H7C2G1 150 aa8.38□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 TAL2Q16559 108 aa8.37□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 Q1RN00 199 aa8.37□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.37□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 CFC1BP0CG36 223 aa8.36□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 IFITM1P13164 125 aa8.36□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.36□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.36□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 HSD52Q0P140 79 aa8.35□□□□□ -1.07
NME3-211ENST00000568561 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms