RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8N814 137 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 USP17L23D6RBM5 183 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACYP1P07311 99 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 VPREB1P12018 145 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 SYCNQ0VAF6 134 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00643Q86TS7 51 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A087WVE0 104 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM168BA1KXE4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00575Q6W349 94 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00167Q96N53 147 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 MUC7Q8TAX7 377 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 B9D2Q9BPU9 175 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 UPK3BQ9BT76 320 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 APLNQ9ULZ1 77 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0R2N4 97 aa6.59□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 IMUPQ9GZP8 106 aa6.58□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 M0R378 163 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZQY7 126 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 DIRC1Q969H9 104 aa6.57□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCKP06307 115 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 C7orf33Q8WU49 177 aa6.56□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX7BP24311 80 aa6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 TGP01266 2768 aa6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 RMI2Q96E14 147 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 ATOX1O00244 68 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCNDBP1-210ENST00000566882 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 KMT2AQ03164 3969 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6JHZ5 121 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.52□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSCAO43653 123 aa6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZQT0 140 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBN3Q75N90 2809 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A096LNI7 61 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.5□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHTF8P0CG12 524 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAH2Q9P225 4427 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PNN7 141 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 EPM2AB3EWF7 344 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.48□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 PRR15Q8IV56 129 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q9BRP9 147 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCXQ7RTU7 201 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 SERP2Q8N6R1 65 aa6.47□□□□□ -1.37
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUPR2A6NF83 97 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 HAMPP81172 84 aa6.46□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 ERC2-IT1O76042 136 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBL5Q9BZL1 73 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.45□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 PANO1I0J062 215 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZRX8 168 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZVQ6 151 aa6.44□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q8N377 158 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPRR1AP35321 89 aa6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CCNDBP1-210ENST00000566882 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.42□□□□□ -1.38
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