RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528246.5

MSRA-210, Transcript of methionine sulfoxide reductase A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MSRA, Length 1,706 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRA-210ENST00000528246 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.83□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 HAMPP81172 84 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 H7BZZ5 65 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 FAM236CP0DP71 79 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 C20orf197Q8N268 126 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.81□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 M0R2N4 97 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 C15orf56Q8N910 161 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 HTN3P15516 51 aa6.79□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZRU5 148 aa6.78□□□□□ -1.32
MSRA-210ENST00000528246 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.77□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.77□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.76□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.76□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 OXTP01178 125 aa6.76□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.76□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 Q5XG85 94 aa6.75□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 RYR3Q15413 4870 aa6.75□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 SYCNQ0VAF6 134 aa6.74□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.74□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZRP5 223 aa6.73□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 BPY2O14599 106 aa6.73□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 PRYO14603 147 aa6.73□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.73□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 NREPQ16612 68 aa6.73□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 IGKV4-1P06312 121 aa6.72□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 SPRR1AP35321 89 aa6.72□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.72□□□□□ -1.33
MSRA-210ENST00000528246 ESRGQ1W209 222 aa6.71□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZRX8 168 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 OCR1Q9BZK8 76 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 TNP2Q05952 138 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 Q6ZTC4 211 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 Q8N377 158 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.7□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 F8WEM9 126 aa6.69□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 C7orf33Q8WU49 177 aa6.69□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 SPRR4Q96PI1 79 aa6.68□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 A0A0U1RQV1 116 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 MRAPQ8TCY5 172 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 RMI2Q96E14 147 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 LCE6AA0A183 80 aa6.67□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.66□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 SNURFQ9Y675 71 aa6.66□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 C4orf26Q17RF5 130 aa6.65□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.65□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 SCXQ7RTU7 201 aa6.65□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 Q8NBF4 154 aa6.65□□□□□ -1.34
MSRA-210ENST00000528246 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.64□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.64□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 TENM3Q9P273 2699 aa6.63□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.63□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 A0A1W2PNM2 257 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP10-11P60412 298 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 C1orf137Q5JT78 98 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 Q9BRP9 147 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 COL7A1Q02388 2944 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.62□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.61□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 RETNQ9HD89 108 aa6.61□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.6□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 C3orf84H3BNL1 204 aa6.6□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.59□□□□□ -1.35
MSRA-210ENST00000528246 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.59□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 Q8N9L7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 PRO0628Q9UI54 55 aa6.58□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 REG3GQ6UW15 175 aa6.56□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.56□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.56□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 DSCR10P59022 87 aa6.56□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 SMIM29Q86T20 159 aa6.55□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 FAM168BA1KXE4 195 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 NDUFB1O75438 58 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 H0Y9J4 135 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 K7EIL1 84 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 UBE2BP63146 152 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.53□□□□□ -1.36
MSRA-210ENST00000528246 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms