RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BCP62807 126 aa9.97□□□□□ -0.81
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ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.97□□□□□ -0.81
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ITGA3-215ENST00000515147 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.81□□□□□ -0.84
ITGA3-215ENST00000515147 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.81□□□□□ -0.84
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ITGA3-215ENST00000515147 FABP4P15090 132 aa9.8□□□□□ -0.84
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ITGA3-215ENST00000515147 COX7BP24311 80 aa9.68□□□□□ -0.86
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ITGA3-215ENST00000515147 TAL2Q16559 108 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-215ENST00000515147 C6orf99Q4VX62 202 aa9.67□□□□□ -0.86
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ITGA3-215ENST00000515147 PRO1933Q9H354 126 aa9.67□□□□□ -0.86
ITGA3-215ENST00000515147 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.64□□□□□ -0.87
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ITGA3-215ENST00000515147 C1orf195Q5TG92 126 aa9.63□□□□□ -0.87
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ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.58□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.57□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 KRTDAPP60985 99 aa9.56□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 A0A1B0GWB2 263 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 C3orf79P0CE67 100 aa9.55□□□□□ -0.88
ITGA3-215ENST00000515147 PET117Q6UWS5 81 aa9.55□□□□□ -0.88
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