RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.44□□□□□ -1.86
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CBX1-205ENST00000495350 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 TMEM223A0PJW6 202 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 DPM2O94777 84 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 IGKCP01834 107 aa3.43□□□□□ -1.86
CBX1-205ENST00000495350 PLNP26678 52 aa3.43□□□□□ -1.86
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CBX1-205ENST00000495350 PCOTHQ58A44 107 aa3.4□□□□□ -1.87
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CBX1-205ENST00000495350 E9PLD3 99 aa3.39□□□□□ -1.87
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CBX1-205ENST00000495350 Q6ZVH6 145 aa3.39□□□□□ -1.87
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CBX1-205ENST00000495350 HERV-K104P63124 156 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-205ENST00000495350 ERG28Q9UKR5 140 aa3.38□□□□□ -1.87
CBX1-205ENST00000495350 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.37□□□□□ -1.87
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CBX1-205ENST00000495350 UBE2V1Q13404 147 aa3.37□□□□□ -1.87
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CBX1-205ENST00000495350 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.32□□□□□ -1.88
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CBX1-205ENST00000495350 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.32□□□□□ -1.88
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CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PPM0 123 aa3.31□□□□□ -1.88
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CBX1-205ENST00000495350 TAL2Q16559 108 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 CEND1Q8N111 149 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 RAB37Q96AX2 223 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 K7ERJ3 54 aa3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 IGLV6-57P01721 117 aa3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 Q6Q795 121 aa3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.3□□□□□ -1.88
CBX1-205ENST00000495350 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.3□□□□□ -1.88
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