RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489042.1

FBXO18-214, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 3

Gene FBXO18, Length 478 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-214ENST00000489042 Q6ZRX8 168 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.23□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 J3QQQ9 107 aa7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 PLNP26678 52 aa7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.22□□□□□ -1.25
FBXO18-214ENST00000489042 LINC00587B1AMM8 73 aa7.21□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.21□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 XP32Q5T750 250 aa7.21□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 DPM2O94777 84 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.2□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 IGLV6-57P01721 117 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 IGKCP01834 107 aa7.19□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 HERVK_113P61574 105 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 S100A12P80511 92 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.18□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 SLC25A20O43772 301 aa7.17□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 A0A0J9YXY3 114 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 C9orf92A6NGG3 77 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.15□□□□□ -1.26
FBXO18-214ENST00000489042 NMUP48645 174 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 PET117Q6UWS5 81 aa7.14□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 NDUFC2O95298 119 aa7.13□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 PCOTHQ58A44 107 aa7.13□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 LINC01545Q5VT33 79 aa7.13□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 E9PLD3 99 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.12□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 A0A0G2JQZ4 141 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 H7C2G1 150 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 LITAFQ99732 161 aa7.11□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 C3orf79P0CE67 100 aa7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 MT1HP80294 61 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 Q1RN00 199 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.09□□□□□ -1.27
FBXO18-214ENST00000489042 KRTDAPP60985 99 aa7.08□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.08□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 C20orf202A1L168 122 aa7.06□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 AKR1D1P51857 326 aa7.06□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 SPRR1BP22528 89 aa7.05□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 C6orf99Q4VX62 202 aa7.05□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 SPANXCQ9NY87 97 aa7.05□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 ZNF815PA8K554 130 aa7.04□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 TIMM17BO60830 172 aa7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 COX7BP24311 80 aa7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 LIMD2Q9BT23 127 aa7.03□□□□□ -1.28
FBXO18-214ENST00000489042 S100A2P29034 98 aa7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.02□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 S100A6P06703 90 aa7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 TAL2Q16559 108 aa7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.01□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 SMIM29Q86T20 159 aa7□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 SPANXDQ9BXN6 97 aa7□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.99□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 C5orf52A6NGY3 159 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 C1orf195Q5TG92 126 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.98□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 ATOH7Q8N100 152 aa6.97□□□□□ -1.29
FBXO18-214ENST00000489042 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 COPS9Q8WXC6 57 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 PRO1933Q9H354 126 aa6.96□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 Q6ZVH6 145 aa6.95□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 A6NDN8 102 aa6.94□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.94□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 IFITM1P13164 125 aa6.94□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 CD164Q04900 197 aa6.93□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 PCP2Q8IVA1 136 aa6.93□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 M0R2T5 61 aa6.92□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
FBXO18-214ENST00000489042 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms