RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 AMELXQ99217 191 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 LINC01600Q96MT4 127 aa6.16□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 CLEC2BQ92478 149 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 CHTF8P0CG12 524 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 REG3GQ6UW15 175 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 DIRC1Q969H9 104 aa6.15□□□□□ -1.42
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WYN8 130 aa6.15□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 COX17Q14061 63 aa6.15□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00643Q86TS7 51 aa6.15□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM223A0PJW6 202 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 M0R378 163 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZRP5 223 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 CD164Q04900 197 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 H3BT86 120 aa6.14□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 ATOX1O00244 68 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 CDK2AP2O75956 126 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZR54 194 aa6.13□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0B4J2C4 111 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.12□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 A0A096LNI7 61 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 SNURFQ9Y675 71 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 ACYP1P07311 99 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.11□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0J9YXY3 114 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 COX7BP24311 80 aa6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 SERP2Q8N6R1 65 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 C22orf24Q9Y442 160 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.09□□□□□ -1.43
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.09□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 LST1O00453 97 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 C10orf25Q5T742 122 aa6.08□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 ANK2Q01484 3957 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 C15orf56Q8N910 161 aa6.07□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 SCXQ7RTU7 201 aa6.06□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 PSPHP1O15172 72 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.05□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP10-2P60368 255 aa6.04□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 H0YGX0 51 aa6.03□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.02□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 C6orf99Q4VX62 202 aa6.02□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00167Q96N53 147 aa6.02□□□□□ -1.44
DDX39B-215ENST00000462256 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.02□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 PRLHP81277 87 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 KRTAP10-1P60331 282 aa6.01□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 PRYO14603 147 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 Q5VSD8 79 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 LITAFQ99732 161 aa6□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 VPREB1P12018 145 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 CCKP06307 115 aa5.98□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00846Q9NV44 126 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 BCE1O60756 84 aa5.96□□□□□ -1.45
DDX39B-215ENST00000462256 FAM168BA1KXE4 195 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 A8MU10 97 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 H7BZZ5 65 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 KIAA0087Q14695 138 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 C8orf87E5RJ46 101 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 Q6JHZ5 121 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.95□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 H3BQ85 93 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 PRR4Q16378 134 aa5.94□□□□□ -1.46
DDX39B-215ENST00000462256 FAM104AQ969W3 186 aa5.94□□□□□ -1.46
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