RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 TENM2Q9NT68 2774 aa8.95□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 Q6ZQT0 140 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 PSCAO43653 123 aa8.95□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 PRYO14603 147 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 Q6JHZ5 121 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 DSCR8Q96T75 97 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PTPRN-210ENST00000460801 C14orf177Q52M58 125 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRN-210ENST00000460801 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRN-210ENST00000460801 M0R2N4 97 aa8.88□□□□□ -0.99
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PTPRN-210ENST00000460801 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRN-210ENST00000460801 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRN-210ENST00000460801 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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PTPRN-210ENST00000460801 Q8N377 158 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRN-210ENST00000460801 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.82□□□□□ -1
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PTPRN-210ENST00000460801 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-210ENST00000460801 ERC2-IT1O76042 136 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-210ENST00000460801 Q6ZVQ6 151 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-210ENST00000460801 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRN-210ENST00000460801 UBE2BP63146 152 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRN-210ENST00000460801 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 ATOX1O00244 68 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 HAMPP81172 84 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 Q6ZR54 194 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 CXCL6P80162 114 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRN-210ENST00000460801 PRLHP81277 87 aa8.72□□□□□ -1.01
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PTPRN-210ENST00000460801 H0Y9J4 135 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 C1orf137Q5JT78 98 aa8.7□□□□□ -1.02
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PTPRN-210ENST00000460801 A0A1W2PNM2 257 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 EPM2AB3EWF7 344 aa8.68□□□□□ -1.02
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PTPRN-210ENST00000460801 COX7CP15954 63 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 FBN3Q75N90 2809 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 C3orf84H3BNL1 204 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 NREPQ16612 68 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 Q8NBF4 154 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 KMT2AQ03164 3969 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 SCXQ7RTU7 201 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRN-210ENST00000460801 SERP2Q8N6R1 65 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 DPH3Q96FX2 82 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 SPRR4Q96PI1 79 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 F8WEM9 126 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 TGP01266 2768 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRN-210ENST00000460801 RTL8CO15255 209 aa8.63□□□□□ -1.03
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