RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380751.9

SERF1B-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-202ENST00000380751 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.55□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.54□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.54□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.54□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.53□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 J3QQQ9 107 aa9.53□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 NDUFC2O95298 119 aa9.53□□□□□ -0.88
SERF1B-202ENST00000380751 SNAPINO95295 136 aa9.52□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 YPEL4Q96NS1 127 aa9.52□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 MT1HP80294 61 aa9.51□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 PCOTHQ58A44 107 aa9.51□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 NPC2P61916 151 aa9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 SVBPQ8N300 66 aa9.5□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 LEPROTL1O95214 131 aa9.49□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 C9orf92A6NGG3 77 aa9.48□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 PLNP26678 52 aa9.48□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 NMUP48645 174 aa9.48□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 NDUFA5Q16718 116 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.47□□□□□ -0.89
SERF1B-202ENST00000380751 C5orf52A6NGY3 159 aa9.46□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 DPM2O94777 84 aa9.46□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 HERVK_113P61574 105 aa9.46□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.45□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 LIMD2Q9BT23 127 aa9.45□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 A0A0J9YXY3 114 aa9.44□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 IGKCP01834 107 aa9.44□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR1BP22528 89 aa9.44□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 LINC00310P59036 64 aa9.44□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 SERF1AO75920 110 aa9.43□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 FABP4P15090 132 aa9.43□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 TRGC2P03986 189 aa9.42□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 CFC1BP0CG36 223 aa9.42□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.41□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.41□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.4□□□□□ -0.9
SERF1B-202ENST00000380751 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.39□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 E9PLD3 99 aa9.37□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.36□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.36□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 SPANXCQ9NY87 97 aa9.36□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 H7C2G1 150 aa9.35□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 TAL2Q16559 108 aa9.35□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 Q1RN00 199 aa9.35□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 LITAFQ99732 161 aa9.35□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 CD164Q04900 197 aa9.34□□□□□ -0.91
SERF1B-202ENST00000380751 PRO1933Q9H354 126 aa9.33□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 COX7BP24311 80 aa9.32□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 C6orf99Q4VX62 202 aa9.32□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 M0R2T5 61 aa9.31□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.31□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.3□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 C1orf195Q5TG92 126 aa9.3□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 A0A0G2JQZ4 141 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 TIMM17BO60830 172 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 AKR1D1P51857 326 aa9.29□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 Q5XG85 94 aa9.28□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 SMIM29Q86T20 159 aa9.28□□□□□ -0.92
SERF1B-202ENST00000380751 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.27□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.26□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.25□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.25□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 ZNF815PA8K554 130 aa9.24□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.22□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 COLCA2A8K830 154 aa9.22□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
SERF1B-202ENST00000380751 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 GHRHP01286 108 aa9.2□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 A0A1B0GWB2 263 aa9.19□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 LINC01545Q5VT33 79 aa9.19□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 A6NDN8 102 aa9.17□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.17□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 LCE1DQ5T752 114 aa9.16□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 PET117Q6UWS5 81 aa9.16□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 TCL1BO95988 128 aa9.15□□□□□ -0.94
SERF1B-202ENST00000380751 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.14□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 A4D1N5 150 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BKO60814 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BJP06899 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 C3orf79P0CE67 100 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BOP23527 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BBP33778 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BDP58876 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H2BCP62807 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.11□□□□□ -0.95
SERF1B-202ENST00000380751 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.3 ms