RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01556Q5JQF7 62 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH10Q8IVF4 4471 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS28P62857 69 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM258P61165 79 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP1-201ENST00000357436 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 J3KT08 172 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZVQ6 151 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00588Q9Y4M8 146 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZRP5 223 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 F8WDY8 70 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 CASC10Q5T4H9 136 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TGP01266 2768 aa12.29□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 BCE1O60756 84 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.28□□□□□ -0.44
SH3BP1-201ENST00000357436 DPH3Q96FX2 82 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 HAMPP81172 84 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCNQ0VAF6 134 aa12.27□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 CXCL6P80162 114 aa12.26□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH10OSP0CZ25 163 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV7A0A075B6U4 112 aa12.21□□□□□ -0.45
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.2□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C20orf197Q8N268 126 aa12.19□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAH1Q9P2D7 4330 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TLX1NBP0CAT3 122 aa12.18□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C7orf33Q8WU49 177 aa12.17□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.16□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 STARD9Q9P2P6 4700 aa12.15□□□□□ -0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OXTP01178 125 aa12.14□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 SCXQ7RTU7 201 aa12.12□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KLKP1Q107X0 134 aa12.11□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 H7BZZ5 65 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FBN3Q75N90 2809 aa12.1□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N377 158 aa12.09□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.47
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM168BA1KXE4 195 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 B9D2Q9BPU9 175 aa12.08□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL37AP8A6NKH3 93 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.07□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZRX8 168 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 DEFB105AQ8NG35 78 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRR1AP35321 89 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa12.06□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PRYO14603 147 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM236CP0DP71 79 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa12.05□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RMI2Q96E14 147 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 Q9BRP9 147 aa12.04□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NREPQ16612 68 aa12.03□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 SNURFQ9Y675 71 aa12.02□□□□□ -0.48
SH3BP1-201ENST00000357436 KMT2AQ03164 3969 aa12.02□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 APLNQ9ULZ1 77 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV4-1P06312 121 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 EPM2AB3EWF7 344 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BPY2O14599 106 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8N9L7 120 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 C5orf47Q569G3 176 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 Q5XG85 94 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 C3orf84H3BNL1 204 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TNP2Q05952 138 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PSCAO43653 123 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ERC2-IT1O76042 136 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1B0GW54 56 aa11.96□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 F8WEM9 126 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFC1O43677 76 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PNM2 257 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C4orf26Q17RF5 130 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 OCR1Q9BZK8 76 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.92□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf137Q5JT78 98 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3BP1-201ENST00000357436 REG3GQ6UW15 175 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE2BP63146 152 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 Q8NBF4 154 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPRR4Q96PI1 79 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CHTF8P0CG12 524 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM29Q86T20 159 aa11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms