RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.73□□□□□ -1.65
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RETNQ9HD89 108 aa4.72□□□□□ -1.65
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.64□□□□□ -1.67
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 H3BQ85 93 aa4.61□□□□□ -1.67
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 hDV103S1A0JD37 113 aa4.6□□□□□ -1.67
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 Q6ZQY7 126 aa4.6□□□□□ -1.67
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.6□□□□□ -1.67
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.59□□□□□ -1.67
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IGLV6-57P01721 117 aa4.57□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 COX7BP24311 80 aa4.56□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C15orf56Q8N910 161 aa4.56□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CASC10Q5T4H9 136 aa4.56□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.55□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LCE6AA0A183 80 aa4.55□□□□□ -1.68
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.55□□□□□ -1.68
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