RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 Q8N814 137 aa6.79□□□□□ -1.32
FOXN4-201ENST00000299162 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.78□□□□□ -1.32
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.78□□□□□ -1.32
FOXN4-201ENST00000299162 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.77□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZQY7 126 aa6.77□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.76□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.75□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 CD164Q04900 197 aa6.74□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.74□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZRU5 148 aa6.74□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZVQ6 151 aa6.73□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.73□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.73□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 PRR34Q9NV39 138 aa6.73□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 KLKP1Q107X0 134 aa6.72□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.72□□□□□ -1.33
FOXN4-201ENST00000299162 CASC10Q5T4H9 136 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 PRR15Q8IV56 129 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 A8MU10 97 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 C3orf84H3BNL1 204 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 PRR4Q16378 134 aa6.71□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 COX17Q14061 63 aa6.7□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.7□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 COL7A1Q02388 2944 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZQT0 140 aa6.69□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 K7EIL1 84 aa6.68□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 C15orf56Q8N910 161 aa6.68□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 LYSTQ99698 3801 aa6.68□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.68□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 TGP01266 2768 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 BPY2O14599 106 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 NREPQ16612 68 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00575Q6W349 94 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.67□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 Q6ZRP5 223 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.66□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 SYCNQ0VAF6 134 aa6.65□□□□□ -1.34
FOXN4-201ENST00000299162 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.65□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 FAM168BA1KXE4 195 aa6.65□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 DIRC1Q969H9 104 aa6.65□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 PSPHP1O15172 72 aa6.64□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 MUC7Q8TAX7 377 aa6.64□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.64□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 MDFIQ99750 246 aa6.63□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.62□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 IGLV6-57P01721 117 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 H3BNG1 76 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 H3BS24 57 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 VPREB1P12018 145 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 COX7BP24311 80 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 PSCAO43653 123 aa6.6□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
FOXN4-201ENST00000299162 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 PRYO14603 147 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00167Q96N53 147 aa6.58□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 NDUFC1O43677 76 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 C7orf33Q8WU49 177 aa6.57□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 CXCL6P80162 114 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.55□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 SMIM29Q86T20 159 aa6.54□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 BCE1O60756 84 aa6.54□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 A0A0G2JQZ4 141 aa6.53□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 A0A1W2PNN7 141 aa6.53□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
FOXN4-201ENST00000299162 UBE2BP63146 152 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 CHTF8P0CG12 524 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 PDE6GP18545 87 aa6.52□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.51□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 hDV103S1A0JD37 113 aa6.51□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 A8MUN3 132 aa6.51□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 IGKV4-1P06312 121 aa6.5□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.5□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 Q1T7F1 81 aa6.5□□□□□ -1.37
FOXN4-201ENST00000299162 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms