RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261667.7

KPNA3-201, Transcript of karyopherin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KPNA3, Length 4,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3-201ENST00000261667 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.32□□□□□ -1.24
KPNA3-201ENST00000261667 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.32□□□□□ -1.24
KPNA3-201ENST00000261667 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.32□□□□□ -1.24
KPNA3-201ENST00000261667 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.31□□□□□ -1.24
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KPNA3-201ENST00000261667 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.31□□□□□ -1.24
KPNA3-201ENST00000261667 K7EQZ3 153 aa7.31□□□□□ -1.24
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KPNA3-201ENST00000261667 Q5VV11 94 aa7.27□□□□□ -1.25
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KPNA3-201ENST00000261667 KLK9Q2XQG4 91 aa7.26□□□□□ -1.25
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KPNA3-201ENST00000261667 C4orf3Q8WVX3 66 aa7.25□□□□□ -1.25
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KPNA3-201ENST00000261667 IGLV1-40P01703 118 aa7.22□□□□□ -1.25
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KPNA3-201ENST00000261667 PRLHP81277 87 aa7.14□□□□□ -1.27
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KPNA3-201ENST00000261667 C22orf24Q9Y442 160 aa7.13□□□□□ -1.27
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KPNA3-201ENST00000261667 SPINK7P58062 85 aa7.1□□□□□ -1.27
KPNA3-201ENST00000261667 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.09□□□□□ -1.27
KPNA3-201ENST00000261667 IGKV2-30P06310 120 aa7.09□□□□□ -1.27
KPNA3-201ENST00000261667 X6R8D5 127 aa7.09□□□□□ -1.27
KPNA3-201ENST00000261667 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.09□□□□□ -1.27
KPNA3-201ENST00000261667 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.09□□□□□ -1.27
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KPNA3-201ENST00000261667 Q6ZRX8 168 aa7.09□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 TACC2O95359 2948 aa7.08□□□□□ -1.28
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KPNA3-201ENST00000261667 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
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KPNA3-201ENST00000261667 Q8N377 158 aa7.05□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.05□□□□□ -1.28
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KPNA3-201ENST00000261667 A8MU10 97 aa7.05□□□□□ -1.28
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KPNA3-201ENST00000261667 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.04□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.03□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 FBN2P35556 2912 aa7.03□□□□□ -1.28
KPNA3-201ENST00000261667 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.02□□□□□ -1.28
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