RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV6-57P01721 117 aa17.5■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R2N4 97 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH10Q8IVF4 4471 aa17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 SPAG11BQ08648 103 aa17.48■□□□□ 0.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 DPH3Q96FX2 82 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 ENHOQ6UWT2 76 aa17.47■□□□□ 0.39
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa17.46■□□□□ 0.39
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8NDZ9 215 aa17.43■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 DSCR8Q96T75 97 aa17.43■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa17.43■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR34Q9NV39 138 aa17.42■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa17.41■□□□□ 0.38
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa17.41■□□□□ 0.38
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CAPNS1-201ENST00000246533 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf47Q569G3 176 aa17.35■□□□□ 0.37
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CAPNS1-201ENST00000246533 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa17.33■□□□□ 0.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH17Q9UFH2 4485 aa17.32■□□□□ 0.36
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CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-201ENST00000246533 KLK12Q9UKR0 248 aa17.27■□□□□ 0.36
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 HAMPP81172 84 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf48Q9UBA6 75 aa17.26■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf197Q8N268 126 aa17.25■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL8CO15255 209 aa17.25■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 KLKP1Q107X0 134 aa17.23■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH10OSP0CZ25 163 aa17.22■□□□□ 0.35
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa17.2■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM236CP0DP71 79 aa17.2■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R378 163 aa17.19■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PKD1P98161 4303 aa17.19■□□□□ 0.34
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CAPNS1-201ENST00000246533 OXTP01178 125 aa17.15■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 XAGE1AQ9HD64 81 aa17.15■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PKHD1P08F94 4074 aa17.14■□□□□ 0.34
CAPNS1-201ENST00000246533 H7BZZ5 65 aa17.14■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMK2N2Q96S95 79 aa17.14■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SERP1Q9Y6X1 66 aa17.14■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 EPM2AB3EWF7 344 aa17.12■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00528Q8N1L1 170 aa17.1■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TNP2Q05952 138 aa17.09■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ERC2-IT1O76042 136 aa17.08■□□□□ 0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 Q5XG85 94 aa17.06■□□□□ 0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa17.06■□□□□ 0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00336Q6ZUF6 198 aa17.02■□□□□ 0.32
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GW54 56 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZRU5 148 aa17.01■□□□□ 0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GVY2 172 aa17■□□□□ 0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 HIGD2BQ4VC39 106 aa17■□□□□ 0.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.99■□□□□ 0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf56Q8N910 161 aa16.98■□□□□ 0.31
CAPNS1-201ENST00000246533 NREPQ16612 68 aa16.96■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BPY2O14599 106 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 C4orf26Q17RF5 130 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNQ1DNQ9H478 68 aa16.95■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RMI2Q96E14 147 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.94■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 F8WEM9 126 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SNURFQ9Y675 71 aa16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SCXQ7RTU7 201 aa16.92■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM26A0A096LP01 95 aa16.9■□□□□ 0.3
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZRP5 223 aa16.89■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PSCAO43653 123 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV4-1P06312 121 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 SYCNQ0VAF6 134 aa16.88■□□□□ 0.29
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