RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641901.1

SAMMSON-222, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, human

BASIC

Gene SAMMSON, Length 2,727 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SAMMSON-222	ENST00000641901	SNCG	O76070	127 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LELP1	Q5T871	98 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		5.09	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	GAGE2B	Q13066	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	C6orf223	Q8N319	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LYST	Q99698	3801 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLK12	Q9UKR0	248 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	C10orf25	Q5T742	122 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q8NDZ9	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	LECT2	O14960	151 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	SLPI	P03973	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901		H0YGX0	51 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAL4	O96015	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	CXCL5	P42830	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	SPAG11B	Q08648	103 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	COX17	Q14061	63 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6Q795	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZTC4	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	NCR3	O14931	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	B9D2	Q9BPU9	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	NDUFC2	O95298	119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A0J9YWU9	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	ACYP1	P07311	99 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SAMMSON-222	ENST00000641901	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	ESRG	Q1W209	222 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q8N814	137 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		J3KT08	172 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		H3BNG1	76 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	TENM2	Q9NT68	2774 aa		5	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		A0A1B0GX51	115 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		F8WDY8	70 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZRU5	148 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	CCK	P06307	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	VPREB1	P12018	145 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZQY7	126 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901		Q6ZRP5	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SAMMSON-222	ENST00000641901	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62

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