RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627869.1

CHRNA4-210, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 4 subunit, humanhuman

Gene CHRNA4, Length 496 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4-210ENST00000627869 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.45□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.45□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 HERVK_113P61574 105 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 UBE2V1Q13404 147 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 C2orf82Q6UX34 121 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.44□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 NDUFA1O15239 70 aa7.43□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 SYCNQ0VAF6 134 aa7.43□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.43□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 NMUP48645 174 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.42□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 PRSS2P07478 247 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 SFTA2Q6UW10 78 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 PCP2Q8IVA1 136 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 C7orf33Q8WU49 177 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 CARD19Q96LW7 228 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.41□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 HERV-K104P63124 156 aa7.4□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.4□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 LITAFQ99732 161 aa7.4□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.4□□□□□ -1.22
CHRNA4-210ENST00000627869 TNXBP22105 4242 aa7.4□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 CKS1BP61024 79 aa7.39□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 SPATA45Q537H7 98 aa7.39□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.39□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 VAMP8Q9BV40 100 aa7.39□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 A0A096LNI7 61 aa7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 A0A0J9YXY3 114 aa7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 COX8AP10176 69 aa7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.38□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 COX17Q14061 63 aa7.37□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 ERG28Q9UKR5 140 aa7.37□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 ZNF815PA8K554 130 aa7.36□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.36□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 TIMM17BO60830 172 aa7.36□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 Q6ZRP5 223 aa7.36□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.36□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.35□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 C5orf47Q569G3 176 aa7.35□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.35□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.34□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.34□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.34□□□□□ -1.23
CHRNA4-210ENST00000627869 TSPAN13O95857 204 aa7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SMIM13P0DJ93 91 aa7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 MT1HL1P0DM35 61 aa7.32□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 GAGE2BQ13066 116 aa7.32□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 HIGD1BQ9P298 99 aa7.32□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 Q8NDZ9 215 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 SPANXCQ9NY87 97 aa7.31□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 PFN2P35080 140 aa7.3□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.29□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 Q6ZVH6 145 aa7.29□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.28□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 LINC00158P58513 81 aa7.28□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 DAND5Q8N907 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CHRNA4-210ENST00000627869 A0A0U1RRA0 63 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 A0A1W2PNN7 141 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.27□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 VPREB1P12018 145 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 VAMP3Q15836 100 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 GAGE2EQ4V326 116 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 LINC01600Q96MT4 127 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 SIGMAR1Q99720 223 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.26□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 FAM168BA1KXE4 195 aa7.25□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 IFITM1P13164 125 aa7.25□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 REG3GQ6UW15 175 aa7.25□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 NDUFC2O95298 119 aa7.24□□□□□ -1.25
CHRNA4-210ENST00000627869 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
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