RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	PAX4	O43316	350 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		F8WEM9	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		M0R2N4	97 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8NAQ8	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MGP	P08493	103 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		F5H697	171 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MIF	P14174	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0J9YXV3	536 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	CASC10	Q5T4H9	136 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	KLLN	B2CW77	178 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LETMD1-238	ENST00000623495	ESRG	Q1W209	222 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C16orf74	Q96GX8	76 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	RMI2	Q96E14	147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA1	O15239	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LYST	Q99698	3801 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ENHO	Q6UWT2	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9UF83	564 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9HAA7	133 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	SNURF	Q9Y675	71 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	UBL5	Q9BZL1	73 aa		5	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495		H0YGX0	51 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00315	P59091	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	GYPE	P15421	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495		Q1T7F1	81 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.96	□□□□□ -1.61
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZSN1	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	NCR3	O14931	201 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	CRP	P02741	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WYN8	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MTW9	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFS5	O43920	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N3U1	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	CCL18	P55774	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495	UBE2B	P63146	152 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QY20	66 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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